39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1410 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1410  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 116 aa  241  3e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000126907  hitchhiker  0.000639527 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1910  conserved hypothetical protein  36.52 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0237  hypothetical protein  47.83 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.211231 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1314  hypothetical protein  44 
 
 		 231 aa  63.9  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2423  hypothetical protein  37.11 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0484  XRE family transcriptional regulator  39 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0290  hypothetical protein  35.14 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0204  hypothetical protein  50 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.803129 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2124  hypothetical protein  37.11 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1213  hypothetical protein  34 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0359  hypothetical protein  34.29 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0262  hypothetical protein  41.67 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.233822 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0770  hypothetical protein  46.03 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1152  hypothetical protein  45.16 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1846  transcriptional regulator, fis family  32.65 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2998  hypothetical protein  33.71 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2036  Fis family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.494843  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2388  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673915  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0397  transcriptional regulator, Fis family  34.65 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0200714  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0791  hypothetical protein  26.85 
 
 		 116 aa  50.8  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.181075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2046  transcriptional regulator, fis family  31.63 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.03951  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0295  transcriptional regulator-like  40.98 
 
 		 126 aa  50.1  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  41.51 
 
 		 306 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.111494 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1398  hypothetical protein  30 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000179385 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0176  hypothetical protein  41.51 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1717  hypothetical protein  32.35 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1934  hypothetical protein  29.36 
 
 		 289 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0090  helix-turn-helix domain-containing protein  37.04 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.592947  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1384  hypothetical protein  34.57 
 
 		 289 aa  43.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0941  hypothetical protein  32.1 
 
 		 290 aa  42.7  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2596  fis family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2048  hypothetical protein  31.31 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000899924  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0934  hypothetical protein  27.5 
 
 		 138 aa  42  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0839  hypothetical protein  36.36 
 
 		 290 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.660796  normal  0.142658 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 309 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 307 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1034  hypothetical protein  31.87 
 
 		 323 aa  40.4  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00255835 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2413  transcriptional regulator, XRE family  30.68 
 
 		 299 aa  40  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0533  hypothetical protein  32 
 
 		 121 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>