32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5385 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_5385  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
249 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5307  protein of unknown function DUF81  84.45 
 
 
249 aa  377  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4839  hypothetical protein  84.87 
 
 
249 aa  368  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21149  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4336  hypothetical protein  70.68 
 
 
270 aa  330  9e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  66.12 
 
 
253 aa  322  3e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1865  hypothetical protein  62.86 
 
 
251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0039  protein of unknown function DUF81  66.39 
 
 
249 aa  299  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.162734  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2500  hypothetical protein  70.56 
 
 
251 aa  292  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.617054  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4283  hypothetical protein  63.27 
 
 
250 aa  281  9e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293053  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5622  hypothetical protein  59.84 
 
 
248 aa  277  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.355042  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0021  hypothetical protein  63.64 
 
 
247 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  39.66 
 
 
247 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1851  hypothetical protein  60.71 
 
 
146 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.749637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22430  hypothetical protein  45.54 
 
 
243 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  35.47 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  35.47 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  36.14 
 
 
248 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3972  hypothetical protein  33.33 
 
 
250 aa  92.8  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.965925 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8662  protein of unknown function DUF81  31.97 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3491  hypothetical protein  29.86 
 
 
242 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  29.33 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  27.04 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  28.26 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  27.16 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  27.16 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  27.16 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  26.8 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3036  protein of unknown function DUF81  26.97 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  24.15 
 
 
241 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  23.4 
 
 
241 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4878  protein of unknown function DUF81  26.94 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000490098  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1794  hypothetical protein  22.18 
 
 
241 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>