237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4075 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4075  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 		 113 aa  229  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.402367 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1133  flagellar basal body rod protein FlgC  48.28 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1518  flagellar basal body rod protein FlgC  46.55 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0198818  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1393  flagellar basal body rod protein FlgC  46.55 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0993913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5496  flagellar basal body rod protein FlgC  44.83 
 
 		 141 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1367  flagellar basal body rod protein FlgC  46.49 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4410  flagellar basal body rod protein FlgC  44.83 
 
 		 141 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.541352  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0297  flagellar basal body rod protein FlgC  44.83 
 
 		 139 aa  97.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3776  flagellar basal body rod protein FlgC  44.83 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0600625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2607  flagellar basal body rod protein FlgC  45.69 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122012  normal  0.267532 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2830  flagellar basal body rod protein FlgC  45.69 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.172073  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0256  flagellar basal body rod protein FlgC  44.83 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1937  flagellar basal body rod protein FlgC  43.48 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2571  flagellar basal body rod protein FlgC  47.01 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1143  flagellar basal body rod protein FlgC  43.48 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0350  flagellar basal body rod protein FlgC  44.83 
 
 		 138 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.121375 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0737  flagellar basal body rod protein FlgC  44.44 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1694  flagellar basal body rod protein FlgC  42.24 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0318  flagellar basal body rod protein FlgC  43.97 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.783853  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2637  flagellar basal body rod protein FlgC  44.83 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.296466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0136  flagellar basal body rod protein FlgC  42.24 
 
 		 140 aa  90.5  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0597  flagellar basal body rod protein FlgC  43.7 
 
 		 138 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5537  flagellar basal body rod protein FlgC  43.48 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132652  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4211  flagellar basal body rod protein FlgC  41.38 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0152  flagellar basal body rod protein FlgC  43.24 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2234  flagellar basal body rod protein FlgC  41.53 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0025  flagellar basal body rod protein FlgC  40.34 
 
 		 140 aa  87  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1095  flagellar basal body rod protein FlgC  39.83 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0944  flagellar basal body rod protein FlgC  41.07 
 
 		 136 aa  87  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.255907  normal  0.801291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1691  flagellar basal body rod protein FlgC  41.74 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.132509  normal  0.0178 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  41.18 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3674  flagellar basal body rod protein FlgC  41.38 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523112 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5154  flagellar basal body rod protein FlgC  41.74 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205426  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3438  flagellar basal body rod protein FlgC  37.39 
 
 		 135 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2825  flagellar basal body rod protein FlgC  38.79 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3655  flagellar basal body rod protein FlgC  38.79 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.633505  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2133  flagellar basal body rod protein FlgC  36.84 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  42.48 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  42.48 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  39.47 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  42.48 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3019  flagellar basal body rod protein FlgC  37.82 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.92 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  38.05 
 
 		 134 aa  76.6  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  36.97 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  39.66 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  38.05 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2410  flagellar basal body rod protein FlgC  36.97 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3024  flagellar basal body rod protein FlgC  36.97 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0826465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3043  flagellar basal body rod protein FlgC  36.97 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2934  flagellar basal body rod protein FlgC  36.13 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.725751 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1526  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.23 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3069  flagellar basal body rod protein FlgC  36.13 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.17 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1644  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.52 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000317866  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0141  flagellar basal body rod protein FlgC  39.5 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1977  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.17 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  38.94 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3793  flagellar basal body rod protein FlgC  38.66 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.4 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0705  flagellar basal body rod protein FlgC  32.64 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.16 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  37.07 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  37.07 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  37.07 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0630  flagellar basal body rod protein FlgC  43.1 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.652584  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  37.07 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  36.13 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  37.07 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0619  flagellar basal body rod protein FlgC  43.1 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.017127  normal  0.0984024 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.43 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  35.29 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3713  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.72 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.277072 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  35.29 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4790  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.72 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  35.29 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  35.29 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  35.29 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  35.29 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  35.29 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  38.05 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  37.07 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.07 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  37.07 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  37.07 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  37.07 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  37.07 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  37.07 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  37.07 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  37.07 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.25 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2666  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.87 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1109  flagellar basal body rod protein FlgC  36.92 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151882  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0343  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.6 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.962617 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1357  flagellar basal body rod protein FlgC  38.14 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.75 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5626  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.96 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1194  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.62 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0355  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.86 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.4 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>