More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2507 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 134 aa  271  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  97.01 
 
 		 139 aa  265  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  95.52 
 
 		 139 aa  260  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  87.5 
 
 		 151 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  87.29 
 
 		 139 aa  216  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  81.75 
 
 		 139 aa  214  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2218  putative Acyl-CoA thioester hydrolase  70.97 
 
 		 136 aa  179  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  64.8 
 
 		 142 aa  170  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  67.23 
 
 		 129 aa  163  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3235  thioesterase superfamily protein  64 
 
 		 143 aa  160  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561934 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1614  thioesterase superfamily protein  57.26 
 
 		 129 aa  160  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00678446  normal  0.171125 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  59.2 
 
 		 130 aa  157  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1943  acyl-CoA thioester hydrolase  57.94 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2184  acyl-CoA thioester hydrolase  58.73 
 
 		 140 aa  153  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1945  acyl-CoA thioester hydrolase  56.45 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2054  acyl-CoA thioester hydrolase  56.45 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.678705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2327  acyl-CoA thioester hydrolase  56.45 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.176788  normal  0.862202 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1655  thioesterase superfamily protein  56 
 
 		 129 aa  151  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2296  acyl-CoA thioester hydrolase  56.1 
 
 		 140 aa  150  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1869  acyl-CoA thioester hydrolase  55.04 
 
 		 130 aa  149  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.592837  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1592  acyl-CoA thioester hydrolase  55.04 
 
 		 130 aa  149  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849233 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1863  acyl-CoA thioester hydrolase  55.04 
 
 		 130 aa  149  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2125  thioesterase superfamily protein  59.02 
 
 		 130 aa  149  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1410  acyl-CoA thioester hydrolase  55.04 
 
 		 130 aa  149  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.429  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  56.59 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1996  acyl-CoA thioester hydrolase  54.84 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02769  hypothetical protein  54.14 
 
 		 169 aa  148  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  57.72 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  57.72 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1146  acyl-CoA thioester hydrolase (p14 protein)  55.2 
 
 		 140 aa  148  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1305  hypothetical protein  53.38 
 
 		 146 aa  148  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000164666  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1510  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase, putative  55.2 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1460  putative long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  55.2 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2286  acyl-CoA thioester hydrolase  54.76 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704866  normal  0.744488 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01227  predicted hydrolase  56 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2395  thioesterase superfamily protein  56 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0166309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1879  acyl-CoA thioester hydrolase  56 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231895 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01237  hypothetical protein  56 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1362  acyl-CoA thioester hydrolase  56 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000133322  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1422  acyl-CoA thioester hydrolase  56 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.126928  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1926  acyl-CoA thioester hydrolase  54.26 
 
 		 130 aa  146  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369936 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2374  acyl-CoA thioester hydrolase  56 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0799784  hitchhiker  0.00000127096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1411  acyl-CoA thioester hydrolase  56 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.414324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1740  acyl-CoA thioester hydrolase  55.2 
 
 		 132 aa  144  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000269584  hitchhiker  0.00394303 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1268  acyl-CoA hydrolase  54.55 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.415542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  54.03 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2128  thioesterase superfamily protein  58.4 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003074  putative acyl-coA hydrolase  51.88 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  57.02 
 
 		 154 aa  141  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1004  thioesterase superfamily protein  55.74 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.648637  normal  0.368957 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0782  thioesterase superfamily protein  51.94 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000656912  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2678  acyl-CoA thioester hydrolase  53.66 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.234171  hitchhiker  0.00125297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1366  thioesterase superfamily protein  55.46 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147408  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2890  hypothetical protein  52.5 
 
 		 126 aa  141  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2745  hypothetical protein  52.5 
 
 		 126 aa  141  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1457  thioesterase superfamily protein  54.4 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.412041  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3758  putative acyl-CoA thioester hydrolase  52.1 
 
 		 134 aa  138  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1220  thioesterase superfamily protein  52.42 
 
 		 141 aa  137  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0603  thioesterase superfamily protein  54.4 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.926269 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4080  thioesterase superfamily protein  53.39 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0822  thioesterase superfamily protein  53.85 
 
 		 141 aa  133  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2709  thioesterase superfamily protein  52.76 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1282  thioesterase superfamily protein  53.28 
 
 		 136 aa  130  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.484211 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1489  thioesterase superfamily protein  56.78 
 
 		 142 aa  130  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.596462 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0580  thioesterase superfamily protein  51.24 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3494  thioesterase superfamily protein  49.17 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0601  thioesterase superfamily protein  51.24 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.71789 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4187  thioesterase superfamily protein  52.5 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3907  thioesterase superfamily protein  51.26 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0682264  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1348  thioesterase superfamily protein  52.54 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0858  thioesterase superfamily protein  48.78 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5489  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  51.61 
 
 		 133 aa  123  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5043  thioesterase superfamily protein  51.61 
 
 		 133 aa  123  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0451  thioesterase superfamily protein  50.86 
 
 		 133 aa  123  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0157  thioesterase superfamily protein  53.33 
 
 		 138 aa  123  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0390  thioesterase superfamily protein  49.6 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3463  thioesterase superfamily protein  49.57 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.211669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0349  thioesterase superfamily protein  48.78 
 
 		 151 aa  120  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2709  thioesterase superfamily protein  51.64 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0353  thioesterase superfamily protein  47.86 
 
 		 145 aa  120  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0368  thioesterase superfamily protein  47.86 
 
 		 145 aa  120  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0438  acyl-CoA hydrolase-like protein  49.57 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6530  thioesterase superfamily protein  55.65 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.018702  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1929  thioesterase superfamily protein  53.33 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.433296  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2205  thioesterase superfamily protein  53.33 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4027  thioesterase superfamily protein  51.69 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000934062 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0082  thioesterase superfamily protein  48.39 
 
 		 133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0477  hypothetical protein  47.86 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1820  thioesterase superfamily protein  52.5 
 
 		 139 aa  117  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.45574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6156  hypothetical protein  47.29 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.015412  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70930  hypothetical protein  47.29 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.193161 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3630  thioesterase superfamily protein  41.98 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249001  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6721  thioesterase superfamily protein  55.45 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0422424  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15050  acyl-CoA hydrolase  46.49 
 
 		 152 aa  113  7.999999999999999e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0809768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0359  putative acyl-CoA thioester hydrolase  47.83 
 
 		 155 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183567  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5331  thioesterase superfamily protein  46.51 
 
 		 132 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.941741  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4028  thioesterase domain-containing protein  42.11 
 
 		 131 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.210569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0143  thioesterase superfamily protein  46.51 
 
 		 132 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5239  thioesterase superfamily protein  46.51 
 
 		 132 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327766  normal  0.0636832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5380  thioesterase superfamily protein  46.51 
 
 		 132 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  0.245761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>