More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0982 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0982  formyl transferase domain protein  100 
 
 
288 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1060  formyl transferase domain-containing protein  88.89 
 
 
288 aa  532  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.113837 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1190  formyl transferase domain protein  88.54 
 
 
288 aa  529  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.738205  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1761  formyl transferase domain protein  79.86 
 
 
288 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5456  formyl transferase domain-containing protein  78.47 
 
 
288 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0931925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5625  formyl transferase domain-containing protein  79.86 
 
 
287 aa  447  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.11456  normal  0.165091 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5891  formyl transferase domain-containing protein  50.36 
 
 
284 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487641  normal  0.0186917 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5673  formyl transferase domain-containing protein  50.36 
 
 
284 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0384109 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  25.18 
 
 
278 aa  84  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00312  methionyl-tRNA formyltransferase  29.06 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  30.45 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  28.52 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  26.53 
 
 
311 aa  72.4  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  27.92 
 
 
315 aa  72.4  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  30.74 
 
 
308 aa  72  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  27.78 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  26.13 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  25.33 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0284  methionyl-tRNA formyltransferase  29.66 
 
 
315 aa  68.9  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0176978 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  24.2 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  24.2 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  26.48 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  25.09 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117163  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0633  formyl transferase domain protein  29.95 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.353643  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1644  methionyl-tRNA formyltransferase  35.71 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  25.78 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  25.78 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  25.78 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  25.78 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  25.78 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  27.43 
 
 
316 aa  65.5  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2150  methionyl-tRNA formyltransferase  21.09 
 
 
323 aa  65.1  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  26.83 
 
 
324 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  26.83 
 
 
315 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  25.44 
 
 
315 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  25.44 
 
 
313 aa  64.7  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  25.09 
 
 
315 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  32.93 
 
 
301 aa  64.3  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  25.85 
 
 
315 aa  63.2  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  25.85 
 
 
315 aa  63.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  25.85 
 
 
315 aa  63.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0831  methionyl-tRNA formyltransferase  30.1 
 
 
327 aa  62.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  25.08 
 
 
317 aa  62.8  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0907  methionyl-tRNA formyltransferase  27.85 
 
 
310 aa  62.8  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000822843  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4501  formyl transferase domain-containing protein  29.95 
 
 
564 aa  62.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0099906 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  25.44 
 
 
315 aa  62.8  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  25.09 
 
 
315 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  27.31 
 
 
315 aa  62.4  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0036  methionyl-tRNA formyltransferase  28.41 
 
 
327 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  26.13 
 
 
313 aa  61.6  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  26.67 
 
 
312 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0663  methionyl-tRNA formyltransferase  22.61 
 
 
312 aa  60.8  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1467  methionyl-tRNA formyltransferase  28.81 
 
 
306 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0397972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  25.23 
 
 
309 aa  60.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1514  methionyl-tRNA formyltransferase  25.79 
 
 
321 aa  60.8  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  28.07 
 
 
313 aa  60.8  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  23.53 
 
 
312 aa  60.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  27.99 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  19.79 
 
 
319 aa  59.7  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  31.49 
 
 
327 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0160  methionyl-tRNA formyltransferase  31.49 
 
 
327 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  31.49 
 
 
327 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  27.53 
 
 
308 aa  59.3  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  24.39 
 
 
315 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0143  methionyl-tRNA formyltransferase  31.49 
 
 
327 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2249  formyl transferase domain protein  27.1 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000319035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  28.35 
 
 
314 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  24.39 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2805  methionyl-tRNA formyltransferase  31.49 
 
 
337 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  28.28 
 
 
305 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4569  formyl transferase domain-containing protein  27.16 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  31.35 
 
 
327 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  24.39 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  24.39 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2275  methionyl-tRNA formyltransferase  31.49 
 
 
337 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2353  methionyl-tRNA formyltransferase  31.49 
 
 
337 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  24.39 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1236  formyltransferase, putative  22.34 
 
 
296 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000369668  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3725  Methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 
311 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.715086  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3877  methionyl-tRNA formyltransferase  27.88 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  24.9 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3123  methionyl-tRNA formyltransferase  29.83 
 
 
327 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.760657  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  24.9 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0415  methionyl-tRNA formyltransferase  23.78 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.467918  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  26.43 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2627  methionyl-tRNA formyltransferase  28.63 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.640895  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0017  formyl transferase domain-containing protein  31.58 
 
 
292 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0278166  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6477  methionyl-tRNA formyltransferase  29.83 
 
 
327 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.79537 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  24.82 
 
 
316 aa  57.4  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4638  methionyl-tRNA formyltransferase  25.51 
 
 
357 aa  57  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.857325  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  25 
 
 
348 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.596014  normal  0.0248257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  29.12 
 
 
327 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  25.69 
 
 
317 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  21.51 
 
 
301 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000190251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  27.83 
 
 
318 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  27.27 
 
 
310 aa  57  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0236  methionyl-tRNA formyltransferase  23.18 
 
 
303 aa  57  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  25.44 
 
 
318 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  29.03 
 
 
307 aa  57  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  26.76 
 
 
310 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>