23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0169 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0169  hypothetical protein  100 
 
 		 489 aa  911    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.559059  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0051  hypothetical protein  61.21 
 
 		 508 aa  409  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1518  hypothetical protein  38.87 
 
 		 445 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.7159  hitchhiker  0.00152141 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04390  hypothetical protein  36.91 
 
 		 499 aa  168  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230297 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0757  hypothetical protein  36.46 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03990  hypothetical protein  32.81 
 
 		 611 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.311503 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1234  hypothetical protein  36.97 
 
 		 439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000907369  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03397  conserved hypothetical protein  24.1 
 
 		 461 aa  88.2  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.485233 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  32.28 
 
 		 1748 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  30.07 
 
 		 1770 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  30.18 
 
 		 1770 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  32.27 
 
 		 1753 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  30.27 
 
 		 1762 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  30.27 
 
 		 1762 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  30.27 
 
 		 1763 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  25.69 
 
 		 1008 aa  57  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  26.78 
 
 		 947 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  45.16 
 
 		 769 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  26.79 
 
 		 1070 aa  51.2  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  44.26 
 
 		 709 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  25.52 
 
 		 1067 aa  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.99 
 
 		 2800 aa  46.2  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.44 
 
 		 1086 aa  45.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>