16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04390 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04390  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  982    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230297 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0757  hypothetical protein  47.45 
 
 		 446 aa  266  8e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1518  hypothetical protein  45.6 
 
 		 445 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.7159  hitchhiker  0.00152141 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1234  hypothetical protein  43.4 
 
 		 439 aa  234  4.0000000000000004e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000907369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0051  hypothetical protein  42.11 
 
 		 508 aa  216  9e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0169  hypothetical protein  36.91 
 
 		 489 aa  171  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.559059  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03990  hypothetical protein  32.39 
 
 		 611 aa  125  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.311503 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03397  conserved hypothetical protein  26.6 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.485233 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  27.21 
 
 		 1753 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  25.7 
 
 		 1748 aa  54.7  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  33.05 
 
 		 995 aa  51.2  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  23.67 
 
 		 1762 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  36.62 
 
 		 1770 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  23.67 
 
 		 1762 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  24.38 
 
 		 1763 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  32 
 
 		 1040 aa  43.9  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>