12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0757 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1518  hypothetical protein  88.57 
 
 
445 aa  722    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.7159  hitchhiker  0.00152141 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0757  hypothetical protein  100 
 
 
446 aa  874    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04390  hypothetical protein  47.72 
 
 
499 aa  257  3e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230297 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1234  hypothetical protein  41.13 
 
 
439 aa  212  1e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000907369  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0051  hypothetical protein  38.44 
 
 
508 aa  192  9e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0169  hypothetical protein  35.36 
 
 
489 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.559059  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03990  hypothetical protein  34.79 
 
 
611 aa  162  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.311503 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03397  conserved hypothetical protein  24.18 
 
 
461 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.485233 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  28.2 
 
 
1762 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  28.2 
 
 
1762 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  27.54 
 
 
1763 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  26.25 
 
 
1753 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>