10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1234 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1234  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  854    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000907369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04390  hypothetical protein  44.64 
 
 		 499 aa  254  2.0000000000000002e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230297 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0757  hypothetical protein  41.13 
 
 		 446 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1518  hypothetical protein  39.66 
 
 		 445 aa  233  6e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.7159  hitchhiker  0.00152141 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0051  hypothetical protein  39.13 
 
 		 508 aa  192  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0169  hypothetical protein  36.97 
 
 		 489 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.559059  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03990  hypothetical protein  35.26 
 
 		 611 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.311503 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03397  conserved hypothetical protein  23.76 
 
 		 461 aa  61.6  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.485233 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  27.24 
 
 		 1748 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  26.69 
 
 		 1753 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>