14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1518 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1518  hypothetical protein  100 
 
 
445 aa  866    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.7159  hitchhiker  0.00152141 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0757  hypothetical protein  88.57 
 
 
446 aa  705    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04390  hypothetical protein  45.6 
 
 
499 aa  245  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230297 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1234  hypothetical protein  39.66 
 
 
439 aa  204  2e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000907369  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0051  hypothetical protein  38.96 
 
 
508 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0169  hypothetical protein  37.59 
 
 
489 aa  177  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.559059  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03990  hypothetical protein  36.62 
 
 
611 aa  170  4e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.311503 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03397  conserved hypothetical protein  24.32 
 
 
461 aa  67.8  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.485233 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  27.2 
 
 
1762 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  27.2 
 
 
1762 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  30.3 
 
 
1770 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  30.3 
 
 
1770 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  25.09 
 
 
1763 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  30.3 
 
 
1753 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>