146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8620 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8620  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  354  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8431  hypothetical protein  90.61 
 
 		 181 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6884  hypothetical protein  82.14 
 
 		 181 aa  269  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6134  hypothetical protein  71.75 
 
 		 167 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1175  hypothetical protein  62.21 
 
 		 182 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3062  hypothetical protein  61.63 
 
 		 181 aa  206  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.823663  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  60.48 
 
 		 353 aa  186  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  60.48 
 
 		 353 aa  186  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  51.38 
 
 		 352 aa  168  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  51.38 
 
 		 352 aa  168  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  51.38 
 
 		 352 aa  168  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  51.38 
 
 		 352 aa  168  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  51.38 
 
 		 352 aa  168  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  51.38 
 
 		 352 aa  168  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  51.38 
 
 		 352 aa  168  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  51.38 
 
 		 352 aa  168  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  51.38 
 
 		 352 aa  168  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  51.38 
 
 		 352 aa  168  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  51.38 
 
 		 352 aa  168  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  51.38 
 
 		 352 aa  168  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  51.38 
 
 		 352 aa  168  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  51.38 
 
 		 352 aa  168  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  51.38 
 
 		 352 aa  168  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2837  hypothetical protein  57.46 
 
 		 187 aa  155  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4058  transposase and inactivated derivative  48.8 
 
 		 169 aa  154  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.407481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2042  transposase and inactivated derivative  48.17 
 
 		 169 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  48.5 
 
 		 356 aa  123  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  46.71 
 
 		 356 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  48.5 
 
 		 356 aa  123  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  47.9 
 
 		 356 aa  122  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3114  transposase  39.75 
 
 		 169 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8498  hypothetical protein  78.33 
 
 		 102 aa  87  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3611  hypothetical protein  63.22 
 
 		 96 aa  84.7  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.159699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0244  ISSod10, transposase OrfA  30.14 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3812  ISSod10, transposase OrfA  30.14 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1476  putative transposase protein  35.83 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0002  transposase and inactivated derivative  26.75 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1345  transposase and inactivated derivative  26.75 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.738368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1360  transposase and inactivated derivative  26.75 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2699  transposase and inactivated derivative  26.75 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0801317  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3194  transposase and inactivated derivative  26.75 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3793  ISSod10, transposase OrfA  28.67 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.97835  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3636  IS630 family transposase  32.47 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2275  ISSod10, transposase OrfA  28.08 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2874  ISSod10, transposase OrfA  28.08 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4533  ISSod10, transposase OrfA  28.08 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0130  ISSod10, transposase OrfA  28 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0420595  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0673  ISSod10, transposase OrfA  28 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000190511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0675  ISSod10, transposase OrfA  28 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3795  ISSod10, transposase OrfA  28 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000216362  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1512  transposase and inactivated derivative  26.11 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.110681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1558  ISSod10, transposase OrfA  28 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0211  ISSod10, transposase OrfA  29.37 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4313  putative transposase protein  35.1 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00177  transposase  27.15 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00185  transposase  27.15 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00187  transposase  27.15 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00189  transposase  27.15 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00191  transposase  27.15 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00318  hypothetical protein  27.15 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00320  hypothetical protein  27.15 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00322  hypothetical protein  27.15 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00369  hypothetical protein  27.15 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00371  hypothetical protein  27.15 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00476  hypothetical protein  27.15 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01018  hypothetical protein  27.15 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01035  hypothetical protein  27.15 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01802  hypothetical protein  27.15 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02170  hypothetical protein  27.15 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03714  hypothetical protein  27.15 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1910  transposase and inactivated derivative  32.14 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.976788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2574  transposase and inactivated derivative  32.14 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0224006  decreased coverage  0.000135385 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.1 
 
 		 350 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3886  IS630 family transposase  32.62 
 
 		 167 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00228342  normal  0.0587286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4771  putative transposase  31.85 
 
 		 282 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.1 
 
 		 350 aa  51.2  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3419  putative transposase  31.93 
 
 		 211 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.963439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.1 
 
 		 350 aa  51.2  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  31.85 
 
 		 363 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  31.85 
 
 		 363 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  31.85 
 
 		 363 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  31.85 
 
 		 363 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  31.85 
 
 		 363 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  31.85 
 
 		 363 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2030  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.1 
 
 		 350 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4323  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.1 
 
 		 350 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2425  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.1 
 
 		 350 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  31.85 
 
 		 363 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3464  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.1 
 
 		 350 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.16 
 
 		 350 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  30.32 
 
 		 364 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2505  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.81 
 
 		 350 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11687  normal  0.0450356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2897  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.81 
 
 		 350 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1450  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.81 
 
 		 350 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3719  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.81 
 
 		 350 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3552  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.81 
 
 		 350 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4537  hypothetical protein  26.67 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.81 
 
 		 350 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1833  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.81 
 
 		 350 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1894  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.81 
 
 		 350 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>