34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3611 on replicon NC_009471
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009471  Acry_3611  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  188  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.159699  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2837  hypothetical protein  69.74 
 
 
187 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3062  hypothetical protein  67.95 
 
 
181 aa  103  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.823663  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  65.43 
 
 
353 aa  103  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  65.43 
 
 
353 aa  103  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  61.63 
 
 
352 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  61.63 
 
 
352 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  61.63 
 
 
352 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  61.63 
 
 
352 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  61.63 
 
 
352 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  61.63 
 
 
352 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  61.63 
 
 
352 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  61.63 
 
 
352 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  61.63 
 
 
352 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  61.63 
 
 
352 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  61.63 
 
 
352 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  61.63 
 
 
352 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  61.63 
 
 
352 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  61.63 
 
 
352 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6884  hypothetical protein  63.22 
 
 
181 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  61.63 
 
 
352 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1175  hypothetical protein  65.43 
 
 
182 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8620  hypothetical protein  63.22 
 
 
181 aa  100  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4058  transposase and inactivated derivative  53.49 
 
 
169 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.407481  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8431  hypothetical protein  65.06 
 
 
181 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2042  transposase and inactivated derivative  52.33 
 
 
169 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  58.14 
 
 
356 aa  77.8  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  58.62 
 
 
356 aa  77.4  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  58.62 
 
 
356 aa  77.4  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  59.3 
 
 
356 aa  77.4  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6134  hypothetical protein  59.32 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3114  transposase  43.37 
 
 
169 aa  60.5  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8498  hypothetical protein  50.67 
 
 
102 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1476  putative transposase protein  51.06 
 
 
172 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>