47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7061 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2283  AAA ATPase  70.82 
 
 		 511 aa  637    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7061  AAA ATPase  100 
 
 		 500 aa  972    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0332905  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6246  AAA ATPase  93.09 
 
 		 520 aa  808    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_004310  BR1534  hypothetical protein  66.47 
 
 		 513 aa  618  1e-176  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1483  hypothetical protein  66.67 
 
 		 511 aa  620  1e-176  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1632  hypothetical protein  68.12 
 
 		 514 aa  607  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1920  hypothetical protein  64.11 
 
 		 526 aa  605  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1948  AAA ATPase  63.23 
 
 		 503 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315114  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5552  hypothetical protein  67.27 
 
 		 498 aa  597  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3442  hypothetical protein  66.8 
 
 		 499 aa  592  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal  0.022696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3638  hypothetical protein  67.01 
 
 		 500 aa  592  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.689622  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3751  hypothetical protein  66.6 
 
 		 499 aa  590  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0972722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1579  ATPase-like protein  66.6 
 
 		 498 aa  587  1e-166  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0994986  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2157  AAA ATPase  62.9 
 
 		 504 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.969754  normal  0.641302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6263  hypothetical protein  63.6 
 
 		 504 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311693 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3413  ATPase  63.44 
 
 		 516 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2167  AAA ATPase  63.49 
 
 		 507 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  62.92 
 
 		 506 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1515  AAA ATPase  60.73 
 
 		 504 aa  570  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2732  hypothetical protein  63.74 
 
 		 510 aa  570  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393853  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  60.92 
 
 		 502 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.197027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3657  ATPase-like protein  61.9 
 
 		 490 aa  549  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0592  hypothetical protein  60.76 
 
 		 498 aa  526  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000492944 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  58.1 
 
 		 492 aa  521  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  58.4 
 
 		 504 aa  507  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  29.18 
 
 		 537 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  27.34 
 
 		 744 aa  59.3  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  25.22 
 
 		 655 aa  58.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  28.08 
 
 		 595 aa  57  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  25.81 
 
 		 659 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  21.6 
 
 		 250 aa  54.7  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  25.79 
 
 		 580 aa  55.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1423  HAD family hydrolase  34.51 
 
 		 550 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  32.57 
 
 		 608 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  32.57 
 
 		 608 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  26.98 
 
 		 628 aa  47.8  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  25.95 
 
 		 574 aa  47.4  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0804  protein of unknown function DUF87  25.31 
 
 		 629 aa  47  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  29.91 
 
 		 582 aa  47  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  30.77 
 
 		 1076 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  23.76 
 
 		 508 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  28.19 
 
 		 579 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  29.07 
 
 		 524 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  24.82 
 
 		 524 aa  44.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1450  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 		 581 aa  44.7  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0452751  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  25.77 
 
 		 611 aa  44.3  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  29.51 
 
 		 605 aa  43.1  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>