25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6859 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6859  ATP-grasp enzyme-like protein  100 
 
 		 400 aa  819    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1460  ATP-grasp enzyme-like protein  38.56 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1119  ATP-grasp enzyme-like protein  38.24 
 
 		 405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6484  ATP-grasp enzyme-like protein  37.7 
 
 		 405 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  32.72 
 
 		 411 aa  152  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  28.75 
 
 		 408 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  29.06 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  28.12 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  23.94 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  24.31 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  27.4 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  26.18 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  27.2 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  23.72 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  23.76 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  24.76 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  27.75 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  25.42 
 
 		 426 aa  54.3  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  25.99 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  25.41 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  22.01 
 
 		 404 aa  50.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  23.91 
 
 		 753 aa  49.7  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0466  hypothetical protein  22.7 
 
 		 413 aa  47  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  27.31 
 
 		 382 aa  43.1  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.26 
 
 		 723 aa  43.1  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>