More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3053 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
611 aa  1222    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  65.49 
 
 
698 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2878  serine/threonine protein kinase  66.29 
 
 
626 aa  327  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104503 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2349  serine/threonine protein kinase  57.66 
 
 
616 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.769925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1332  serine/threonine protein kinase  62.2 
 
 
609 aa  296  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0913  serine/threonine protein kinase  62.06 
 
 
615 aa  296  9e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.754008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  52.7 
 
 
497 aa  237  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  52.68 
 
 
491 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  50 
 
 
654 aa  233  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  48.74 
 
 
616 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  49.58 
 
 
657 aa  232  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  45.08 
 
 
413 aa  229  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  46.22 
 
 
535 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  48.1 
 
 
523 aa  213  9e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  43.94 
 
 
570 aa  208  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 
617 aa  190  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  28.42 
 
 
637 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  29.37 
 
 
620 aa  180  8e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  29.26 
 
 
616 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3134  Serine/threonine protein kinase  41.38 
 
 
427 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3872  protein kinase  41.38 
 
 
424 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0696421  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3418  hypothetical protein  41.87 
 
 
423 aa  171  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  25.89 
 
 
637 aa  166  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  26.74 
 
 
625 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  40.3 
 
 
292 aa  158  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  40.74 
 
 
291 aa  154  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  42.8 
 
 
289 aa  153  8e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  25.96 
 
 
621 aa  153  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  25.58 
 
 
620 aa  150  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3119  protein kinase  37.23 
 
 
668 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0323879 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3475  Serine/threonine protein kinase  37.23 
 
 
668 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  24.96 
 
 
618 aa  148  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  26.05 
 
 
593 aa  147  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  36.48 
 
 
802 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  29.4 
 
 
621 aa  145  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  39.48 
 
 
593 aa  145  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  37.66 
 
 
416 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 
861 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.33 
 
 
591 aa  140  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26980  serine/threonine protein kinase  37.59 
 
 
538 aa  140  7.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  31.48 
 
 
586 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  38.66 
 
 
351 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  35 
 
 
346 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2441  protein kinase  38.27 
 
 
701 aa  137  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.77399  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.15 
 
 
681 aa  137  6.0000000000000005e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  39.13 
 
 
587 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.17 
 
 
693 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  38.29 
 
 
763 aa  135  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  34.31 
 
 
551 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  38.16 
 
 
740 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  37.5 
 
 
758 aa  134  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  35.74 
 
 
1911 aa  134  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.36 
 
 
601 aa  134  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  38.33 
 
 
632 aa  133  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.59 
 
 
603 aa  133  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3668  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.15 
 
 
553 aa  133  9e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  37.11 
 
 
721 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3396  serine/threonine protein kinase  35.74 
 
 
604 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0692149  normal  0.384469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.49 
 
 
700 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  37.29 
 
 
277 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  32.98 
 
 
517 aa  132  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  37.96 
 
 
636 aa  132  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  32.18 
 
 
556 aa  132  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  38.46 
 
 
527 aa  131  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.28 
 
 
653 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  37.64 
 
 
597 aa  131  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  39.74 
 
 
559 aa  131  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.59 
 
 
647 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  39.07 
 
 
877 aa  130  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  38.61 
 
 
603 aa  130  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  38.91 
 
 
301 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.3 
 
 
668 aa  130  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  35.34 
 
 
468 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  35.29 
 
 
609 aa  130  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0020  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.6 
 
 
648 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  37.33 
 
 
661 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.02 
 
 
650 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.21 
 
 
598 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.91 
 
 
613 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  34.93 
 
 
292 aa  128  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  36.36 
 
 
358 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 
497 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.42 
 
 
664 aa  127  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  33.49 
 
 
426 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  38.63 
 
 
691 aa  127  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.16 
 
 
602 aa  127  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  36.73 
 
 
667 aa  127  6e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  33.05 
 
 
240 aa  127  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  37.21 
 
 
882 aa  127  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0329  protein kinase  33.42 
 
 
615 aa  127  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0711079  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  38.02 
 
 
538 aa  127  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  38.74 
 
 
691 aa  127  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  32.7 
 
 
628 aa  127  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  35.02 
 
 
736 aa  126  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.53 
 
 
668 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  36.19 
 
 
286 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.46 
 
 
676 aa  126  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  34.81 
 
 
403 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  36.07 
 
 
761 aa  126  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1158  serine/threonine protein kinase  32.65 
 
 
647 aa  125  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.429913  normal  0.143954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>