21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2531 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2531  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  723    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2418  hypothetical protein  44.89 
 
 		 363 aa  255  9e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4964  hypothetical protein  34.32 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4310  hypothetical protein  25.5 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.23754  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3174  hypothetical protein  30.28 
 
 		 633 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2516  hypothetical protein  33.63 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15116  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  31.62 
 
 		 631 aa  70.5  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.84 
 
 		 721 aa  68.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3473  hypothetical protein  26.02 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.34 
 
 		 724 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.09 
 
 		 720 aa  65.9  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  32.61 
 
 		 741 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2816  serine protease  26.58 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  28.04 
 
 		 677 aa  59.7  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5196  V8-like protein Glu-specific endopeptidase-like protein  28.91 
 
 		 694 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710887  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3556  hypothetical protein  30.06 
 
 		 369 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0917866  normal  0.0496884 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4438  hypothetical protein  29.52 
 
 		 601 aa  53.1  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.13249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0023  PKD repeat-containing protein  28.04 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02448  protease  26.27 
 
 		 482 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3749  hypothetical protein  22.08 
 
 		 572 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0422  hypothetical protein  26.5 
 
 		 476 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>