More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0652 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0652  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
260 aa  521  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2897  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.33 
 
 
271 aa  158  8e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  39.44 
 
 
263 aa  158  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  39.44 
 
 
263 aa  158  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4190  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.95 
 
 
268 aa  155  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.164544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  40.36 
 
 
262 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.87 
 
 
263 aa  151  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  40.35 
 
 
260 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  40.64 
 
 
262 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  40.72 
 
 
262 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  40.72 
 
 
262 aa  149  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  40.72 
 
 
262 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  40.72 
 
 
262 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  40.72 
 
 
262 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  40.72 
 
 
262 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  40.72 
 
 
262 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  40.72 
 
 
262 aa  149  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  34.16 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001548  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.12 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.34 
 
 
662 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  34.1 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  41.47 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.89 
 
 
662 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  35.83 
 
 
663 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 
270 aa  145  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.92 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.69 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
261 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  37.95 
 
 
257 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.44 
 
 
260 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  37.96 
 
 
265 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  37.28 
 
 
259 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.01 
 
 
266 aa  143  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 
263 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 
263 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 
263 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 
263 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  40.35 
 
 
260 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.4 
 
 
661 aa  143  3e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  41.44 
 
 
263 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
257 aa  142  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.51 
 
 
260 aa  142  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.48 
 
 
257 aa  142  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.63 
 
 
268 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
262 aa  142  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.54 
 
 
662 aa  142  6e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.24 
 
 
256 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3572  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
259 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.34 
 
 
258 aa  142  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  35.08 
 
 
263 aa  141  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  39.46 
 
 
262 aa  141  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  43.54 
 
 
258 aa  141  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  38.93 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  38.75 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  40.38 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.64 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.27 
 
 
258 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.71 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  40.37 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.22 
 
 
278 aa  139  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
258 aa  139  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
262 aa  139  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01705  enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 
265 aa  138  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.834387  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.13 
 
 
267 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.15 
 
 
259 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
260 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.75 
 
 
262 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  38.14 
 
 
269 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.37 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  38.25 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.86 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  34.02 
 
 
257 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.46 
 
 
260 aa  136  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.45 
 
 
258 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.27 
 
 
261 aa  136  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000372  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.65 
 
 
258 aa  136  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.616977  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.54 
 
 
258 aa  136  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.86 
 
 
260 aa  136  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 
259 aa  136  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3078  short chain enoyl-CoA hydratase  38.05 
 
 
258 aa  135  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13392  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  34.89 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  34.89 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  34.89 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.61 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  35.89 
 
 
280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  34.89 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.98 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 
277 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  34.43 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.51 
 
 
259 aa  135  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>