43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1134 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1134  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 
158 aa  323  6e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3776  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.71 
 
 
169 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0933459  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4100  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.08 
 
 
169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3451  hypothetical protein  36.05 
 
 
161 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40700  hypothetical protein  35.37 
 
 
165 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311323  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2937  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  37.59 
 
 
173 aa  104  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4608  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.44 
 
 
172 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1123  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  36.42 
 
 
171 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0151  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.54 
 
 
182 aa  101  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4247  hypothetical protein  34.81 
 
 
169 aa  99.8  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3044  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.18 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1835  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.72 
 
 
167 aa  99  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0751413  normal  0.748451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0317  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.73 
 
 
169 aa  98.6  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0187831  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0355  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  33.12 
 
 
162 aa  97.4  7e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296793  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0894  hypothetical protein  30.38 
 
 
180 aa  90.5  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0838  hypothetical protein  30.38 
 
 
180 aa  90.5  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.746637  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2601  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  35.71 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432616 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3283  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.33 
 
 
173 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3997  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.62 
 
 
169 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4037  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.18 
 
 
169 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150637  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2482  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.06 
 
 
170 aa  87  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0857  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.41 
 
 
154 aa  87  9e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1314  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.39 
 
 
182 aa  87  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.683617  hitchhiker  0.00106774 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3742  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.62 
 
 
169 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.160925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4591  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.2 
 
 
168 aa  84.7  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.190429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.88 
 
 
175 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2315  hypothetical protein  31.01 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1922  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.03 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4451  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.66 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0780502  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3035  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  24.46 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000118066  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4795  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  24.49 
 
 
159 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.075177  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-like protein  29.03 
 
 
162 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.702018  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5115  hypothetical protein  24.49 
 
 
159 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109943  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5108  hypothetical protein  24.49 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1546  hypothetical protein  38.33 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5075  hypothetical protein  24.49 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5204  hypothetical protein  24.49 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.475528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4839  hypothetical protein  24.49 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0119961  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4697  DNA-binding protein  26.47 
 
 
159 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.397642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0125  hypothetical protein  25 
 
 
159 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00974203  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5113  hypothetical protein  23.81 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000743566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4681  DNA-binding protein  23.81 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3567  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  23.13 
 
 
158 aa  44.3  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>