53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2429 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2429  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
419 aa  860    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3903  hypothetical protein  26.88 
 
 
405 aa  142  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2760  hypothetical protein  26.47 
 
 
413 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.385888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  23.1 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  25.56 
 
 
484 aa  56.6  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  22.36 
 
 
408 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1085  glycosyl transferase, group 1  22.76 
 
 
430 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  24.34 
 
 
463 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2794  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
404 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
516 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 
415 aa  54.3  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.37 
 
 
432 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  21.37 
 
 
432 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
370 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  23.28 
 
 
415 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.71 
 
 
424 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  20.96 
 
 
402 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1825  glycosyl transferase group 1  20.19 
 
 
353 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
386 aa  50.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 
409 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1092  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 
381 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  20.85 
 
 
433 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  23.28 
 
 
381 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1854  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
377 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  22.19 
 
 
385 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
672 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  23.69 
 
 
410 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 
414 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  20.98 
 
 
457 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  21.62 
 
 
373 aa  47  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
377 aa  46.6  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1957  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.5 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 
859 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3120  glycosyl transferase, group 1  22.45 
 
 
372 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 
370 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
373 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
467 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 
426 aa  45.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.15 
 
 
383 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
458 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4643  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
518 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39122  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1050  glycosyl transferase group 1  22.42 
 
 
349 aa  44.3  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.806851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 
413 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  18.55 
 
 
430 aa  44.3  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
376 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
384 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0588  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
367 aa  43.9  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.147569  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  27.03 
 
 
417 aa  43.9  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2781  a-glycosyltransferase  21.1 
 
 
378 aa  43.5  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27166  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 
445 aa  43.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  23.19 
 
 
409 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  22.12 
 
 
375 aa  43.1  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>