55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1092 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1092  putative chemotaxis protein CheX  100 
 
 		 159 aa  320  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1530  type IV pilus assembly PilZ  41.51 
 
 		 300 aa  124  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174773  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  38.85 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1769  inhibitor of MCP methylation-like protein  35.9 
 
 		 217 aa  84  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0802325  hitchhiker  0.000530497 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  33.56 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  33.04 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  36.7 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  40.96 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  35.44 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  35 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  36 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  26.45 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  34.18 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  33.03 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  31.65 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  29.73 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  30 
 
 		 166 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0811  chemotaxis protein CheX, putative  30.19 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  26.36 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  26.47 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  30 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  34.72 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  26.04 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  28.07 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  25.17 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  25 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  25.17 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0760  putative chemotaxis protein CheX  25.17 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000652399  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  25.17 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  25.17 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  23.57 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  25.17 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  25.17 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  25.17 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3584  hypothetical protein  30.77 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0132  hypothetical protein  29.46 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  22.86 
 
 		 155 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  27.19 
 
 		 160 aa  44.3  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  28.16 
 
 		 184 aa  43.9  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5000  hypothetical protein  37.33 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2679  chemotaxis protein CheX, putative  25.47 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.513529 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  24.81 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  25.71 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  34.33 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1932  CheC domain protein  26.67 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0227289  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0151  CheC domain-containing protein  27.78 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2787  hypothetical protein  25 
 
 		 153 aa  42  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.834766  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  26.26 
 
 		 155 aa  41.6  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2308  CheC-like protein  24.51 
 
 		 154 aa  41.6  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2263  CheC domain protein  25 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000104148  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  29.63 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4204  CheC domain-containing protein  26.06 
 
 		 204 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.994344  hitchhiker  0.00000174212 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  25.52 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1176  CheC-like protein  31.03 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1604  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.3 
 
 		 464 aa  40.4  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>