29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1719 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1719  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  595  1e-169  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.436251 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0884  hypothetical protein  84.21 
 
 		 312 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.172772  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0192  cell wall binding repeat 2-containing protein  72.03 
 
 		 297 aa  422  1e-117  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1720  aminoacyl-tRNA synthetase, class II  37.36 
 
 		 288 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.980612  normal  0.790966 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0892  cell wall binding repeat 2-containing protein  31.36 
 
 		 379 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0893  cell wall binding repeat 2-containing protein  31.62 
 
 		 363 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.62 
 
 		 543 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.76 
 
 		 530 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0187  hypothetical protein  32.82 
 
 		 672 aa  50.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  30.43 
 
 		 637 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1318  hypothetical protein  29.79 
 
 		 664 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0405  PKD domain-containing protein  30.58 
 
 		 1141 aa  48.5  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.13 
 
 		 706 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  37.18 
 
 		 1045 aa  47  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  32.56 
 
 		 570 aa  46.6  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1359  hypothetical protein  28.26 
 
 		 668 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000437253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  27.13 
 
 		 833 aa  45.8  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.23 
 
 		 649 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  35.94 
 
 		 551 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.68 
 
 		 847 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0594  hypothetical protein  27.94 
 
 		 663 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0419099  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.57 
 
 		 860 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  33.96 
 
 		 1312 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0821  cell wall-binding domain-containing protein  33.07 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.03 
 
 		 510 aa  43.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  32.29 
 
 		 1073 aa  43.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.23 
 
 		 795 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  27 
 
 		 600 aa  42.7  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.23 
 
 		 326 aa  42.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>