26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0884 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0884  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  624  1e-178  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.172772  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1719  hypothetical protein  81.91 
 
 
296 aa  477  1e-133  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.436251 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0192  cell wall binding repeat 2-containing protein  74.13 
 
 
297 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1720  aminoacyl-tRNA synthetase, class II  36.98 
 
 
288 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.980612  normal  0.790966 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0892  cell wall binding repeat 2-containing protein  33.94 
 
 
379 aa  149  6e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0893  cell wall binding repeat 2-containing protein  33.6 
 
 
363 aa  132  6e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.03 
 
 
543 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  33.7 
 
 
637 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0187  hypothetical protein  34.48 
 
 
672 aa  53.1  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1318  hypothetical protein  31.3 
 
 
664 aa  53.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0405  PKD domain-containing protein  31.4 
 
 
1141 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.11 
 
 
530 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.89 
 
 
847 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  35.9 
 
 
1045 aa  49.3  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0594  hypothetical protein  28.91 
 
 
663 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0419099  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.68 
 
 
706 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  31.13 
 
 
1073 aa  47  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.4 
 
 
649 aa  46.2  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.7 
 
 
795 aa  46.2  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1359  hypothetical protein  26.61 
 
 
668 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.0000000437253 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0821  cell wall-binding domain-containing protein  36.94 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  31.4 
 
 
570 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.73 
 
 
860 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  33.93 
 
 
551 aa  43.5  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.35 
 
 
885 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  28.57 
 
 
1312 aa  42.4  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>