More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1577 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  100 
 
 
383 aa  741    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  87.47 
 
 
383 aa  629  1e-179  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  87.73 
 
 
385 aa  608  1e-173  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  77.6 
 
 
384 aa  550  1e-155  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  46.45 
 
 
406 aa  349  6e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  30.89 
 
 
397 aa  139  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  28.12 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  30.83 
 
 
395 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  24.6 
 
 
387 aa  114  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  26.37 
 
 
381 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
403 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  24.87 
 
 
381 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  25.33 
 
 
381 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  25.33 
 
 
381 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  25.07 
 
 
381 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  25.69 
 
 
381 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  28.69 
 
 
390 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  24.87 
 
 
399 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.53 
 
 
388 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.53 
 
 
388 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  25.07 
 
 
384 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  25.55 
 
 
407 aa  103  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  25.33 
 
 
381 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  23.64 
 
 
400 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  23.12 
 
 
506 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  25.42 
 
 
381 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  23.8 
 
 
391 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 
395 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  23.64 
 
 
399 aa  99.8  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 
425 aa  99.8  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  22.6 
 
 
400 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  23.12 
 
 
505 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  23.1 
 
 
506 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  22.86 
 
 
400 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  22.86 
 
 
400 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  25.71 
 
 
412 aa  99  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  22.34 
 
 
447 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  22.6 
 
 
400 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  22.72 
 
 
400 aa  97.4  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
391 aa  96.7  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  24.79 
 
 
416 aa  96.7  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  24.55 
 
 
416 aa  96.7  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  25 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  22.31 
 
 
407 aa  94.4  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  30.86 
 
 
400 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  30.77 
 
 
387 aa  94  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  30.04 
 
 
400 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  26.61 
 
 
387 aa  92.8  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 
404 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 
387 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  25 
 
 
391 aa  92.4  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 
389 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  25.07 
 
 
390 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  25.07 
 
 
390 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  30.04 
 
 
400 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  24.56 
 
 
387 aa  91.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 
398 aa  90.5  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  25.34 
 
 
390 aa  90.5  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  25.27 
 
 
390 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  25.07 
 
 
392 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 
406 aa  89.4  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  25.45 
 
 
390 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  25 
 
 
390 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 
409 aa  88.6  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 
390 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 
392 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 
398 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  27.76 
 
 
407 aa  87  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  24.93 
 
 
384 aa  87  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  25.14 
 
 
399 aa  86.7  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  24.28 
 
 
421 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
401 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40779  predicted protein  24.87 
 
 
685 aa  85.9  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  25.73 
 
 
419 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  32.47 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  24.73 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  21.6 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  24.17 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  25.29 
 
 
409 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 
424 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15060  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.139374  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  24.33 
 
 
384 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  26.76 
 
 
403 aa  84  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 
410 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  25.58 
 
 
399 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  24.32 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 
423 aa  82.8  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  25.58 
 
 
399 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 
421 aa  82.8  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  28.52 
 
 
406 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  25.29 
 
 
399 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  24.24 
 
 
384 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  24.31 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  25.29 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  23.62 
 
 
421 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  23.48 
 
 
392 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>