More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1527 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  50.65 
 
 
652 aa  653    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  50.23 
 
 
666 aa  663    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  52.08 
 
 
652 aa  688    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  52.9 
 
 
651 aa  654    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  51.35 
 
 
656 aa  649    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  55.23 
 
 
668 aa  704    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  49.76 
 
 
655 aa  655    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  50.87 
 
 
657 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  100 
 
 
636 aa  1307    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  51.28 
 
 
667 aa  659    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  50.56 
 
 
666 aa  665    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  50.96 
 
 
660 aa  635    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  52 
 
 
661 aa  643    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  51.6 
 
 
649 aa  649    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  49.44 
 
 
649 aa  644    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  50.48 
 
 
656 aa  640    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  54.13 
 
 
666 aa  713    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  54.76 
 
 
670 aa  694    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  51.48 
 
 
629 aa  642    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  51.69 
 
 
638 aa  678    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  52.56 
 
 
652 aa  695    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  50.48 
 
 
667 aa  670    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  49.76 
 
 
655 aa  655    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  52.88 
 
 
652 aa  698    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  51.05 
 
 
652 aa  653    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  53.53 
 
 
666 aa  686    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  52.36 
 
 
644 aa  637    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  52.24 
 
 
655 aa  652    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  53.39 
 
 
648 aa  668    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  50.4 
 
 
649 aa  643    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  97.33 
 
 
636 aa  1281    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  96.54 
 
 
636 aa  1276    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  52.54 
 
 
656 aa  722    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  50.48 
 
 
667 aa  669    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  55.94 
 
 
638 aa  739    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  51.7 
 
 
663 aa  662    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  51.37 
 
 
657 aa  684    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  54.29 
 
 
667 aa  712    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  51.04 
 
 
664 aa  680    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  49.53 
 
 
664 aa  641    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  51.2 
 
 
655 aa  639    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  50.72 
 
 
664 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  50.72 
 
 
664 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  49.84 
 
 
656 aa  634  1e-180  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  50.83 
 
 
643 aa  629  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  49.44 
 
 
657 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  49.84 
 
 
629 aa  631  1e-179  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  49.68 
 
 
658 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  49.84 
 
 
655 aa  629  1e-179  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  50.24 
 
 
650 aa  630  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  50 
 
 
660 aa  631  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  50.81 
 
 
661 aa  629  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  50.91 
 
 
629 aa  629  1e-179  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  50 
 
 
653 aa  625  1e-178  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  49.59 
 
 
650 aa  625  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  49.28 
 
 
667 aa  623  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  48.96 
 
 
657 aa  621  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  49.92 
 
 
649 aa  618  1e-176  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  50.33 
 
 
629 aa  620  1e-176  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  49.84 
 
 
650 aa  621  1e-176  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  48.8 
 
 
658 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0706  acetate/CoA ligase  48.33 
 
 
663 aa  616  1e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  48.64 
 
 
658 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  49.34 
 
 
632 aa  618  1e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  50.9 
 
 
631 aa  616  1e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  49.44 
 
 
661 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  49.43 
 
 
632 aa  611  1e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  48.01 
 
 
657 aa  609  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  49.18 
 
 
625 aa  610  1e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  48.57 
 
 
658 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  49.01 
 
 
670 aa  611  1e-173  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1846  acetyl-CoA synthetase  47.7 
 
 
692 aa  611  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  47.68 
 
 
661 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  48.41 
 
 
673 aa  608  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  48.25 
 
 
652 aa  607  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  49.92 
 
 
674 aa  606  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  50.25 
 
 
626 aa  606  9.999999999999999e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  48.46 
 
 
654 aa  607  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  48.64 
 
 
658 aa  607  9.999999999999999e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  48.89 
 
 
654 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4621  acetyl-CoA synthetase  47.46 
 
 
652 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  49.18 
 
 
635 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  47.22 
 
 
639 aa  602  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4619  acetyl-CoA synthetase  47.46 
 
 
652 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.341691  normal  0.539786 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  49.68 
 
 
657 aa  602  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  47.54 
 
 
631 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  48.59 
 
 
665 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  48.68 
 
 
653 aa  603  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4535  acetyl-CoA synthetase  47.46 
 
 
652 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  51.07 
 
 
631 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  48.71 
 
 
660 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  47.46 
 
 
652 aa  598  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4670  acetyl-CoA synthetase  47.46 
 
 
652 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  47.47 
 
 
631 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  47.38 
 
 
632 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4625  acetyl-CoA synthetase  47.46 
 
 
652 aa  598  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3958  acetyl-CoA synthetase  47.46 
 
 
652 aa  598  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4314  acetyl-CoA synthetase  47.46 
 
 
652 aa  599  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  49.68 
 
 
661 aa  600  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  48.51 
 
 
664 aa  600  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>