153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1458 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1458  glycyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 575 aa  1181    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1227  glycyl-tRNA synthetase  87.8 
 
 		 574 aa  1063    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1294  glycyl-tRNA synthetase  69.81 
 
 		 579 aa  880    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1214  glycyl-tRNA synthetase  97.21 
 
 		 574 aa  1156    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.721399  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0741  glycyl-tRNA synthetase  96.86 
 
 		 574 aa  1148    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483491  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1209  glycyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 607 aa  592  1e-168  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0919  glycyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 581 aa  590  1e-167  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0271  glycyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 577 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.411942  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1156  glycyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 576 aa  547  1e-154  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0814  glycyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 573 aa  542  1e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1061  glycyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 573 aa  543  1e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.238733  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1419  glycyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 576 aa  529  1e-149  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1707  glycyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 572 aa  528  1e-148  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0796  glycyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 589 aa  492  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3710  glycyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 593 aa  492  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12730  predicted protein  43.08 
 
 		 677 aa  483  1e-135  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.384524 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1989  glycyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 630 aa  484  1e-135  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101763  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1488  glycyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 586 aa  473  1e-132  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0734  glycyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 557 aa  465  1e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0237887  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0293  glycyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 594 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0367979  normal  0.30338 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0336  glycyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 590 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11125  glycyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_5G05920)  39.32 
 
 		 689 aa  443  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26972  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00730  glycine-tRNA ligase, putative  37.5 
 
 		 699 aa  429  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64855  cyl-tRNA synthase  38.9 
 
 		 661 aa  431  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0270271 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1628  glycyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 588 aa  431  1e-119  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19761  predicted protein  40.34 
 
 		 702 aa  432  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1420  glycyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 574 aa  427  1e-118  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1821  glycyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 585 aa  422  1e-117  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2213  glycyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.472902  hitchhiker  0.00000523773 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0895  glycyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 585 aa  409  1e-113  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1433  glycyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 		 583 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0288  glycyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 497 aa  295  1e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0063  glycyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 485 aa  277  3e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.823142 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0046  glycyl-tRNA synthetase  30.44 
 
 		 530 aa  277  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0862  glycyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 		 530 aa  271  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1654  glycyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 		 551 aa  270  5.9999999999999995e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50885  predicted protein  31.72 
 
 		 602 aa  268  2e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1451  glycyl-tRNA synthetase  32.07 
 
 		 539 aa  266  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.269775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0933  glycyl-tRNA synthetase  30.46 
 
 		 458 aa  260  5.0000000000000005e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1348  glycyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 462 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000102075  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1581  glycyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 464 aa  227  5.0000000000000005e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3524  glycyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 		 458 aa  226  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2779  glycyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 467 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2465  glycyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 467 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4736  glycyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 458 aa  225  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5053  glycyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 458 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4784  glycyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 458 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.926667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4646  glycyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 458 aa  224  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5147  glycyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 458 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5058  glycyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 458 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5025  glycyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 458 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5046  glycyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 		 458 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0188  glycyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 		 458 aa  223  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4624  glycyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 		 458 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.27496  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3372  glycyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 460 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0775  glycyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 466 aa  220  5e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1312  glycyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 		 462 aa  219  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00852036  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1410  glycyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 		 434 aa  219  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0020  glycyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 451 aa  218  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.485977  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3494  glycyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 		 460 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0648  glycyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 		 462 aa  216  8e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1861  glycyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 		 508 aa  216  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1789  glycyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 		 462 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.143948  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1182  glycyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 461 aa  213  7e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0861  glycyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 462 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.651582  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5268  glycyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 456 aa  213  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3224  glycyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 		 462 aa  213  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0778215  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0740  glycyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 462 aa  212  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0505  glycyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 		 456 aa  211  4e-53  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0275239  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1263  glycyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 448 aa  210  6e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.632012  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1841  glycyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 		 457 aa  209  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0564  glycyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 		 473 aa  209  1e-52  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.425616  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1940  glycyl-tRNA synthetase  32.79 
 
 		 471 aa  207  5e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0293007  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0454  glycine--tRNA ligase  33.61 
 
 		 506 aa  207  5e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl268  glycyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 		 451 aa  207  6e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000087846  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1667  glycyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 		 467 aa  206  8e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0149928  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2182  glycyl-tRNA synthetase  34.64 
 
 		 462 aa  206  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.151014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1776  glycyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 		 462 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0539153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1266  glycyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 		 461 aa  205  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13710  glycyl-tRNA synthetase  34.64 
 
 		 463 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0713  glycyl-tRNA synthetase  34.75 
 
 		 443 aa  203  8e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0134  glycyl-tRNA synthetase  32.7 
 
 		 490 aa  202  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0139549  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1367  glycyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 461 aa  202  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000023951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3433  glycyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 459 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2167  glycyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 466 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0746701  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf348  glycyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 		 463 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0787  glycyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 		 433 aa  201  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.554245  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3818  glycyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 		 468 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196425  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2719  glycyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 		 467 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0770319  normal  0.583311 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_693  glycyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 		 445 aa  201  3e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.538165  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7032  glycyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 		 460 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.761562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2346  anticodon binding domain protein  34.49 
 
 		 461 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13710  glycyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 		 462 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797043  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3810  glycyl-tRNA synthetase  28.16 
 
 		 459 aa  200  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1926  glycyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 		 460 aa  200  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0030323  hitchhiker  0.00269107 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1330  glycyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 		 461 aa  199  9e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3445  glycyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3508  glycyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3456  glycyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.740599  normal  0.258272 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17070  glycyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0010588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>