37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0334 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0334  NERD domain-containing protein  100 
 
 		 225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0988306  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1416  NERD domain-containing protein  81.33 
 
 		 225 aa  360  1e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0503  NERD domain-containing protein  79.56 
 
 		 224 aa  353  1e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.180514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  27.96 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3691  NERD domain-containing protein  30 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.003996  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  29.67 
 
 		 262 aa  71.6  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0751  NERD domain protein  30.43 
 
 		 355 aa  68.6  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.234498  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  26.8 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  27.88 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1607  NERD domain protein  30.16 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3613  NERD domain protein  26.37 
 
 		 228 aa  62  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646238  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  25.65 
 
 		 260 aa  62  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0675  NERD domain-containing protein  29.36 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.160777  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0647  NERD domain-containing protein  27.78 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016807  hitchhiker  0.00000125306 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3657  NERD domain-containing protein  28.7 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.779126  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3374  NERD domain-containing protein  27.78 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000216973  decreased coverage  0.000336538 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0648  NERD domain-containing protein  27.78 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0135957 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3845  NERD domain-containing protein  28.44 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  30.07 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  30.07 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  44.3 
 
 		 329 aa  58.5  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2416  DNA-binding protein  29.79 
 
 		 267 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00817944  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1708  hypothetical protein  22.34 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352686  normal  0.0530118 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  43.04 
 
 		 338 aa  57  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  28.76 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1130  NERD domain-containing protein  25.55 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509839 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  25.99 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2012  NERD domain protein  24.31 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1118  NERD domain protein  26.99 
 
 		 255 aa  52.4  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.2197  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4233  NERD domain-containing protein  22.6 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2594  NERD domain protein  24.42 
 
 		 311 aa  52  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.173089  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1309  NERD domain protein  26.36 
 
 		 262 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3685  NERD domain-containing protein  29.63 
 
 		 353 aa  48.5  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3961  NERD domain-containing protein  25.62 
 
 		 310 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0609224  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0336  hypothetical protein  29 
 
 		 234 aa  45.1  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0849  NERD domain protein  26.03 
 
 		 286 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0019  nerd domain protein  25.13 
 
 		 320 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.580862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>