199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2464 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2464  nucleotidyl transferase  100 
 
 
504 aa  1031    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2595  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  47.76 
 
 
494 aa  475  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0347  nucleotidyl transferase  52.52 
 
 
245 aa  277  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0798326  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0308  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  51.04 
 
 
245 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.684825  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1803  dTDP-glucose pyrophosphorylase  54.08 
 
 
241 aa  272  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0349  nucleotidyl transferase  42.32 
 
 
240 aa  204  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309599  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0305  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  35.97 
 
 
246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.297803  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1806  putative nucleotidyltransferase  38.66 
 
 
241 aa  184  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.716393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0612  nucleotidyl transferase  39.37 
 
 
253 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0706  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  40 
 
 
253 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14021  hypothetical protein  24.81 
 
 
529 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1996  hypothetical protein  24.9 
 
 
548 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0665457 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2751  hypothetical protein  33.73 
 
 
267 aa  113  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0709  hypothetical protein  28.99 
 
 
240 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0423  hypothetical protein  29.63 
 
 
254 aa  110  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0615  hypothetical protein  28.63 
 
 
240 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0732  hypothetical protein  30.24 
 
 
251 aa  108  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2610  hypothetical protein  31.33 
 
 
247 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1800  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.08 
 
 
243 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.6322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1663  hypothetical protein  31.84 
 
 
246 aa  104  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0302  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.75 
 
 
243 aa  94.4  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.04779  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0106  hypothetical protein  28.51 
 
 
240 aa  93.2  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105806 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2750  hypothetical protein  27.24 
 
 
258 aa  92.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3892  hypothetical protein  26.75 
 
 
242 aa  91.7  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4096  hypothetical protein  26.75 
 
 
242 aa  90.9  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.541182 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  23.95 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2596  dolichyl-phosphate mannose synthase  28.44 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  27.23 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  25.68 
 
 
331 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  25.99 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  21.7 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  22.22 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.03 
 
 
331 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  32.04 
 
 
391 aa  65.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  22.98 
 
 
326 aa  65.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  21.4 
 
 
325 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.78 
 
 
355 aa  64.3  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  26.48 
 
 
329 aa  63.9  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  23.47 
 
 
328 aa  63.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  28.26 
 
 
835 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.35 
 
 
355 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  36.07 
 
 
391 aa  62  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0175  nucleotidyl transferase  29.14 
 
 
234 aa  61.2  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.340342  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  24.02 
 
 
257 aa  60.5  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.69 
 
 
359 aa  60.1  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  21.37 
 
 
325 aa  59.7  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.53 
 
 
357 aa  58.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.89 
 
 
357 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  26.82 
 
 
253 aa  57.8  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  21.9 
 
 
325 aa  57  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5632  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  28.39 
 
 
240 aa  57  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  25.81 
 
 
232 aa  56.2  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.43 
 
 
357 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.43 
 
 
357 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.14 
 
 
364 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0077  nucleotidyl transferase  24.55 
 
 
336 aa  55.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.760983 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  24.69 
 
 
236 aa  55.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  19.17 
 
 
349 aa  55.1  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.64 
 
 
354 aa  55.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  23.95 
 
 
245 aa  54.7  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.03 
 
 
355 aa  54.3  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  23.38 
 
 
336 aa  53.9  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  26.1 
 
 
396 aa  53.5  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  25.29 
 
 
387 aa  53.5  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  25.2 
 
 
247 aa  53.5  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.97 
 
 
376 aa  53.5  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.27 
 
 
836 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3469  UDP-glucose pyrophosphorylase  25.49 
 
 
289 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.300387  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  25.27 
 
 
828 aa  52.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2889  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  26.26 
 
 
259 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1971  nucleotidyl transferase  28.64 
 
 
358 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1064  nucleotidyl transferase  23.23 
 
 
338 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  23.21 
 
 
830 aa  52  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.43 
 
 
349 aa  51.2  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1049  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  25.91 
 
 
382 aa  51.2  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  24.24 
 
 
403 aa  50.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  24.02 
 
 
392 aa  51.2  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3621  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25 
 
 
289 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.603812  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2465  hypothetical protein  26.42 
 
 
232 aa  50.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1604  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  21.33 
 
 
493 aa  50.4  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.610155  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  29.29 
 
 
362 aa  50.4  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5131  Nucleotidyl transferase  23.24 
 
 
243 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  25.58 
 
 
827 aa  50.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0738  Nucleotidyl transferase  26.89 
 
 
346 aa  50.1  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0293389  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.57 
 
 
405 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  25.29 
 
 
400 aa  49.7  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.99 
 
 
355 aa  49.3  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4442  Nucleotidyl transferase  28.49 
 
 
306 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0507  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.19 
 
 
291 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0029114  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  26.7 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.44 
 
 
355 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  24.05 
 
 
248 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  23.84 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3553  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25 
 
 
289 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0153  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.5 
 
 
358 aa  49.3  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.34957 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  24.41 
 
 
238 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  25.81 
 
 
835 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.83 
 
 
357 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  23.91 
 
 
836 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  25.87 
 
 
237 aa  48.9  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>