More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2158 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2158  response regulator receiver protein  100 
 
 		 147 aa  291  3e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.693908 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  35.07 
 
 		 1287 aa  77  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2189  response regulator receiver domain-containing protein  34.17 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.029614  normal  0.118925 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  33.85 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3861  response regulator receiver protein  35 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3241  response regulator receiver  33.33 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0160645  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2856  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  29.66 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1773  DNA-binding response regulator  37.07 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1334  response regulator receiver  34.17 
 
 		 181 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1662  response regulator receiver domain-containing protein  34.17 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  42.55 
 
 		 254 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  42.55 
 
 		 254 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  33.33 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  32.48 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  37.58 
 
 		 243 aa  70.9  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2156  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  35.66 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0885  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 697 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  37.16 
 
 		 248 aa  70.1  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  33.62 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  31.9 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3963  response regulator receiver protein  31.5 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.434689  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  31.62 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  35.66 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  38.57 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  32.76 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  31.62 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  35.9 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1873  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2214  response regulator receiver protein  28.78 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3108  response regulator receiver domain-containing protein  29.13 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  38.33 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  38.57 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  38.57 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  36.29 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 		 678 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00885051  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  31.03 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  34.19 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 216 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  31.03 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  31.62 
 
 		 130 aa  67  0.00000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  38.57 
 
 		 243 aa  67  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  31.62 
 
 		 130 aa  67  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  31.62 
 
 		 130 aa  67  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  37.86 
 
 		 243 aa  67  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  34.19 
 
 		 130 aa  67  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3038  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 173 aa  67  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.815906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.4 
 
 		 220 aa  67  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  34.19 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1575  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 		 577 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.09451  normal  0.420465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0390  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  32.12 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0687003  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 1758 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  35.04 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0455  sensor histidine kinase/response regulator LuxN  33.33 
 
 		 686 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0951  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2159  response regulator receiver protein  31.85 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.691441 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  35.04 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3347  DNA-binding transcriptional regulator TorR  40.54 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000384276  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0419  response regulator receiver  33.04 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487855  normal  0.449259 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  34.19 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  35.04 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0452  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2223  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1223  response regulator receiver protein  35 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0062  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 807 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0489  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0483  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 524 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3547  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 524 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>