38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2030 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  100 
 
 
189 aa  372  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  45.39 
 
 
156 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  43.18 
 
 
154 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  58 
 
 
156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  41.4 
 
 
171 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  42.28 
 
 
175 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  40.79 
 
 
157 aa  99  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  42.86 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  41.94 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  43.33 
 
 
155 aa  92  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  49.32 
 
 
155 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  39.31 
 
 
166 aa  91.7  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  47.02 
 
 
128 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3068  DoxX family protein  45.22 
 
 
155 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00512546  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  38 
 
 
154 aa  86.7  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  36.73 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  45.19 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  35.2 
 
 
154 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  41.07 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  34.42 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  38.27 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  33.14 
 
 
172 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  37.76 
 
 
154 aa  62.8  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0727  hypothetical protein  37.21 
 
 
738 aa  60.1  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  40.82 
 
 
151 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  38.78 
 
 
151 aa  58.9  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  40.59 
 
 
145 aa  57.8  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0707  hypothetical protein  35.56 
 
 
738 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  35.71 
 
 
152 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  38.3 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  39.36 
 
 
160 aa  51.2  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  27.22 
 
 
154 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  27.22 
 
 
154 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2957  hypothetical protein  41.35 
 
 
155 aa  48.9  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  39.18 
 
 
139 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  42.4  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  33.33 
 
 
131 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  33.33 
 
 
131 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>