38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1078 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1078  hypothetical protein  100 
 
 		 472 aa  952    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0113368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4327  hypothetical protein  38.11 
 
 		 513 aa  265  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3959  hypothetical protein  37.88 
 
 		 514 aa  263  6e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.134116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1798  hypothetical protein  35.91 
 
 		 508 aa  260  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.113847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1519  hypothetical protein  35.91 
 
 		 508 aa  259  7e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1517  hypothetical protein  35.5 
 
 		 473 aa  257  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1129  hypothetical protein  37.1 
 
 		 514 aa  249  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0265862  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0240  hypothetical protein  36.06 
 
 		 440 aa  239  6.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4762  hypothetical protein  37.88 
 
 		 464 aa  237  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0904  hypothetical protein  35.35 
 
 		 498 aa  229  7e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2407  hypothetical protein  35.36 
 
 		 441 aa  213  7.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01144  hypothetical protein  28.38 
 
 		 428 aa  129  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0508  hypothetical protein  26.81 
 
 		 580 aa  104  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2386  hypothetical protein  28.4 
 
 		 449 aa  76.6  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.164497  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0622  hypothetical protein  25.19 
 
 		 511 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000219002  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  29.28 
 
 		 530 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  24.76 
 
 		 564 aa  60.5  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  24.62 
 
 		 514 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  25.16 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  24.37 
 
 		 514 aa  57  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  25.44 
 
 		 492 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  25.34 
 
 		 502 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  26.86 
 
 		 487 aa  54.3  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  24.56 
 
 		 455 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  25.69 
 
 		 510 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2054  hypothetical protein  24.47 
 
 		 463 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  25.52 
 
 		 509 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  29.63 
 
 		 477 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2317  hypothetical protein  24.84 
 
 		 572 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  26.9 
 
 		 561 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  26.9 
 
 		 553 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  25.35 
 
 		 512 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  25.35 
 
 		 512 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  26.71 
 
 		 529 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2148  hypothetical protein  26.07 
 
 		 460 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000428746  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  23.65 
 
 		 463 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  26.1 
 
 		 480 aa  43.9  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  23.35 
 
 		 463 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>