34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0453 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0453  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  482  1e-135  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1274  hypothetical protein  51.68 
 
 
238 aa  224  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.714961  normal  0.29978 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1292  hypothetical protein  52.12 
 
 
237 aa  216  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0190888  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0136  hypothetical protein  50.64 
 
 
244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1519  hypothetical protein  59.66 
 
 
243 aa  205  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  46.64 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  41.35 
 
 
253 aa  186  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  40 
 
 
237 aa  177  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  38.6 
 
 
247 aa  151  7e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  38.16 
 
 
247 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  38.16 
 
 
247 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  36.09 
 
 
247 aa  141  7e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  36.96 
 
 
248 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0734  ApbE family lipoprotein  38.71 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0103  hypothetical protein  38.27 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.442013  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1439  hypothetical protein  37 
 
 
255 aa  109  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.598717  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1430  ApbE family lipoprotein  39.89 
 
 
255 aa  104  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000126798  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_790  hypothetical protein  38.74 
 
 
249 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2124  hypothetical protein  36.07 
 
 
245 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3586  ApbE family lipoprotein  39.49 
 
 
247 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0803  hypothetical protein  36.98 
 
 
250 aa  95.9  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0919  hypothetical protein  37.17 
 
 
244 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0044  hypothetical protein  34.01 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  33.15 
 
 
247 aa  86.3  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  31.79 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0909  hypothetical protein  43.38 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0139116  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1898  hypothetical protein  35.35 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2328  hypothetical protein  36.03 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2535  hypothetical protein  34.83 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0732  hypothetical protein  31.61 
 
 
237 aa  62  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2147  hypothetical protein  33.04 
 
 
281 aa  52  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4067  hypothetical protein  33.61 
 
 
302 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00673359  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0655  hypothetical protein  36.54 
 
 
313 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4324  hypothetical protein  32.69 
 
 
312 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.344718  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>