21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3045 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_3045  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 516 aa  1045    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2653  tetratricopeptide TPR_2  37.97 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1942  beta-lactamase-like  42.11 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2418  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 332 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2424  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 87 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 169 aa  49.3  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  36.62 
 
 		 562 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  29.87 
 
 		 467 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.96 
 
 		 1056 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  29.69 
 
 		 564 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  22.55 
 
 		 761 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4942  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 		 133 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00284868  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4642  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 		 249 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.25 
 
 		 370 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  27.78 
 
 		 246 aa  44.3  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 217 aa  44.3  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1951  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 476 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 502 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 366 aa  43.5  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  34.33 
 
 		 502 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 502 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>