44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5416 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009339  Mflv_5416  AAA ATPase  100 
 
 		 393 aa  811    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5592  AAA ATPase  100 
 
 		 393 aa  811    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0497  hypothetical protein  45.1 
 
 		 377 aa  311  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4716  hypothetical protein  29.5 
 
 		 354 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0883  hypothetical protein  26.86 
 
 		 373 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3182  putative ATP/GTP-binding protein  26.91 
 
 		 337 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0612  ATP/GTP-binding protein  26.91 
 
 		 337 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.775808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3219  ATP/GTP-binding protein  27.05 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184147  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3574  hypothetical protein  24.3 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0473131 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  27.92 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  27.92 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  27.92 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  27.92 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  25.91 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  22.52 
 
 		 301 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  23.33 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  23.12 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  25.81 
 
 		 289 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  25.81 
 
 		 289 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  22.77 
 
 		 301 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  22.77 
 
 		 301 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  25 
 
 		 296 aa  53.1  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  21.18 
 
 		 293 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  22.41 
 
 		 301 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  21.18 
 
 		 293 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  21.18 
 
 		 293 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  21.18 
 
 		 293 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  24.9 
 
 		 286 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  24.14 
 
 		 308 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  24.88 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  25.29 
 
 		 293 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  26.34 
 
 		 302 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  26.34 
 
 		 302 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  26.34 
 
 		 302 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  23.32 
 
 		 289 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  25.57 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0087  seryl-tRNA(Sec) kinase  25.64 
 
 		 255 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  24.71 
 
 		 292 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  23.23 
 
 		 203 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  26.92 
 
 		 301 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  25.61 
 
 		 302 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0734  chromatin associated protein KTI12  25.37 
 
 		 257 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.394826 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  22.16 
 
 		 497 aa  43.9  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  20.89 
 
 		 302 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>