More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1686 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1686  bifunctional urease subunit gamma/beta  100 
 
 		 234 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.641705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  57 
 
 		 231 aa  235  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  56.04 
 
 		 231 aa  234  8e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  55.77 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  56.04 
 
 		 231 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2411  urease, beta/gamma subunit  55.5 
 
 		 231 aa  228  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2198  bifunctional urease subunit gamma/beta  56.46 
 
 		 231 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  55.56 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0056  urease, beta subunit  52.66 
 
 		 228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0888  bifunctional urease subunit gamma/beta  46.26 
 
 		 215 aa  193  1e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  50.74 
 
 		 206 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  53.23 
 
 		 206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  52.74 
 
 		 206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  51.74 
 
 		 206 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2863  urease, gamma subunit  50.75 
 
 		 206 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.126627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  50.72 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4443  bifunctional urease subunit gamma/beta  44.93 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.836203 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1260  bifunctional urease subunit gamma/beta  40.32 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  50.25 
 
 		 206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4048  bifunctional urease subunit gamma/beta  43.03 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  50.25 
 
 		 206 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0976  bifunctional urease subunit gamma/beta  45 
 
 		 257 aa  168  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.745602  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29702  predicted protein  38.63 
 
 		 878 aa  165  5e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6167  urease, beta subunit  46.58 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.018331 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30221  urease  42.15 
 
 		 840 aa  159  4e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3503  urease, gamma subunit  46.53 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  0.511417 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10079  urease, urea amidohydrolase alpha subunit (Eurofung)  37.21 
 
 		 836 aa  151  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.28583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2768  bifunctional urease subunit gamma/beta  49.47 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2611  urease subunit gamma  47.98 
 
 		 200 aa  146  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.158041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1553  urease subunit gamma  48.94 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01900  urease  40.18 
 
 		 833 aa  137  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0835  urease subunit beta  60.61 
 
 		 106 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0834  bifunctional urease subunit gamma/beta  46.98 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08921  urease subunit beta  59 
 
 		 106 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19251  urease subunit beta  58.16 
 
 		 106 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1054  urease subunit beta  58.16 
 
 		 106 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08941  urease subunit beta  55.56 
 
 		 106 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.349786  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2270  urease, beta subunit  64.89 
 
 		 113 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1817  urease, beta subunit  51.69 
 
 		 122 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0747  urease subunit beta  59.18 
 
 		 102 aa  127  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3620  urease subunit beta  58.82 
 
 		 108 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4836  urease, beta subunit  53.92 
 
 		 122 aa  125  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0921761  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2626  urease subunit beta  61.22 
 
 		 106 aa  125  6e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.531681 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1862  urease, beta subunit  61.96 
 
 		 101 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779138  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2845  urease subunit beta  60.2 
 
 		 117 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1747  urease, beta subunit  60 
 
 		 101 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.641327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2185  urease, beta subunit  61.96 
 
 		 101 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108548 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1559  urease, beta subunit  58.16 
 
 		 142 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4184  urease subunit beta  61.96 
 
 		 101 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2033  urease subunit beta protein  63.04 
 
 		 101 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279697  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0994  urease subunit beta  61.7 
 
 		 101 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2256  urease subunit beta  60.2 
 
 		 106 aa  124  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3695  urease subunit beta  64.13 
 
 		 104 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0960  urease subunit beta  61.7 
 
 		 101 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.657667  normal  0.124248 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0871  urease subunit beta  65.22 
 
 		 101 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2844  urease subunit beta  61.96 
 
 		 105 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7011  urease subunit beta  61.96 
 
 		 101 aa  122  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63705  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1801  urease subunit beta  64.13 
 
 		 101 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2259  urease, beta subunit  60.64 
 
 		 101 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.972861  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1357  urease subunit beta  50.44 
 
 		 159 aa  122  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.4189  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2936  urease subunit beta  59 
 
 		 105 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0308  urease subunit beta  61.7 
 
 		 101 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.441813  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1953  urease subunit beta  61.7 
 
 		 101 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0986  urease subunit beta  62.77 
 
 		 101 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0582515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3693  urease, beta subunit  61.7 
 
 		 101 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.944796  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3503  urease subunit beta  63.04 
 
 		 104 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1473  urease, beta subunit  55.34 
 
 		 126 aa  122  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0929  urease, beta subunit  61.7 
 
 		 101 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1313  urease subunit beta  54.08 
 
 		 164 aa  122  7e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0422  urease subunit beta  64.13 
 
 		 101 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0901  urease subunit beta  64.13 
 
 		 101 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0693  urease subunit beta  63.04 
 
 		 101 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3482  urease subunit beta  60.87 
 
 		 101 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2881  urease  60.64 
 
 		 101 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0668  urease subunit beta  63.44 
 
 		 102 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.164313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0791  urease subunit beta  65.22 
 
 		 101 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1183  urease, beta subunit  60.64 
 
 		 105 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3103  urease, beta subunit  64.13 
 
 		 112 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1026  urease, beta subunit  57.58 
 
 		 103 aa  119  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09890  urease subunit beta  63.04 
 
 		 101 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807213  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0780  urease subunit beta  64.13 
 
 		 101 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2442  urease, beta subunit  59.57 
 
 		 101 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.549938  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4007  urease subunit beta  63.04 
 
 		 101 aa  118  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793578  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0955  urease, beta subunit  57.61 
 
 		 105 aa  118  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1240  urease, beta subunit  54.9 
 
 		 113 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00888  probable urease (beta subunit) protein  60.87 
 
 		 102 aa  118  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29801  urease subunit beta  56 
 
 		 105 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2489  urease subunit beta  61.96 
 
 		 101 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.832851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0183  urease, beta subunit  61.96 
 
 		 106 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0688  urease subunit beta  55.79 
 
 		 106 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2993  urease, beta subunit  60.87 
 
 		 101 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2416  urease subunit beta  59.78 
 
 		 105 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.417471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0726  urease, beta subunit  48.31 
 
 		 127 aa  116  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0581  urease subunit beta  59.78 
 
 		 101 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2714  Urease  48.25 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0334  urease subunit beta  57.61 
 
 		 101 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2066  urease, beta subunit  53.39 
 
 		 147 aa  116  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000367697  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1428  urease, beta subunit  60.87 
 
 		 101 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.767872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3938  urease, beta subunit  59.57 
 
 		 117 aa  115  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4435  urease subunit beta  59.78 
 
 		 101 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.635744  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>