38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1385 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1385  type II secretion system protein  100 
 
 
261 aa  487  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556186  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5406  type II secretion system protein  80.9 
 
 
260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  67.42 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  67.42 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13688  transmembrane protein  55.04 
 
 
266 aa  204  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.76431e-37  normal  0.0719684 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5191  type II secretion system protein  67.98 
 
 
262 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0306742  hitchhiker  0.000243657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3907  Type II secretion system F domain protein  46.04 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0519  Type II secretion system F domain protein  44.63 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  35.8 
 
 
282 aa  96.3  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  35.9 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0277  type II secretion system protein  35.51 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  31.39 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  37.37 
 
 
270 aa  62  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5327  Type II secretion system F domain protein  33.33 
 
 
211 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0528876  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  33.14 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  25.39 
 
 
282 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0593  hypothetical protein  41 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  27.98 
 
 
316 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  26.11 
 
 
310 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  29.1 
 
 
320 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  28.15 
 
 
316 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  37.5 
 
 
271 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  27.32 
 
 
320 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  25.56 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1981  putative integral membrane protein  29.25 
 
 
272 aa  46.6  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0481  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  37.14 
 
 
234 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  26.57 
 
 
322 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  21.93 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  25.68 
 
 
309 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  29.83 
 
 
325 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  24.73 
 
 
332 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5869  hypothetical protein  34.95 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00430744  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  26.95 
 
 
322 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  26.95 
 
 
322 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  29.86 
 
 
448 aa  43.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  19.21 
 
 
337 aa  42.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  26.19 
 
 
310 aa  42.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  33.09 
 
 
322 aa  42  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>