36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0880 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0880  hypothetical protein  100 
 
 
568 aa  1145    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.889726  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5415  hypothetical protein  31.3 
 
 
849 aa  176  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590405  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5593  hypothetical protein  31.3 
 
 
849 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0498  hypothetical protein  34.67 
 
 
269 aa  87.4  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167993  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5413  hypothetical protein  31.48 
 
 
250 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526467  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5595  hypothetical protein  31.48 
 
 
250 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2934  hypothetical protein  25 
 
 
353 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1682  hypothetical protein  25 
 
 
353 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  26.11 
 
 
356 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4978  hypothetical protein  25.88 
 
 
357 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760749 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2522  hypothetical protein  25.11 
 
 
357 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  29.1 
 
 
397 aa  57.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2646  hypothetical protein  29.03 
 
 
497 aa  57  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.0791481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2173  hypothetical protein  29.03 
 
 
497 aa  57  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687306  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4715  hypothetical protein  25.48 
 
 
176 aa  55.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4392  hypothetical protein  25.38 
 
 
344 aa  55.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  27.17 
 
 
433 aa  54.3  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1224  hypothetical protein  30.14 
 
 
472 aa  53.9  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1348  hypothetical protein  30.14 
 
 
472 aa  53.9  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0884  hypothetical protein  31.25 
 
 
556 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  31.82 
 
 
410 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06982  hypothetical protein  25 
 
 
183 aa  51.2  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0542  hypothetical protein  29.71 
 
 
455 aa  50.8  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  22.4 
 
 
378 aa  50.8  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  22.4 
 
 
378 aa  50.8  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4742  hypothetical protein  29.92 
 
 
438 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2128  hypothetical protein  44.19 
 
 
331 aa  47.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0161775 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2503  hypothetical protein  44.19 
 
 
342 aa  47.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3855  hypothetical protein  31.52 
 
 
410 aa  47.4  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0189615 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  23.12 
 
 
342 aa  46.6  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5059  hypothetical protein  34.57 
 
 
268 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  26.53 
 
 
366 aa  45.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3153  hypothetical protein  34.57 
 
 
261 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5215  hypothetical protein  34.57 
 
 
261 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0189  hypothetical protein  21.99 
 
 
307 aa  43.9  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0018  hypothetical protein  31.58 
 
 
567 aa  43.5  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>