203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1450 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1450  cytochrome c, class I  100 
 
 
169 aa  356  9e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0698  cytochrome c class I  45.81 
 
 
189 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2346  cytochrome c class I  52.94 
 
 
187 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2992  cytochrome c class I  54.12 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169382  normal  0.0463014 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6353  cytochrome c class I  52.43 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5245  cytochrome c class I  45.92 
 
 
197 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.330524  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5825  hypothetical protein  46.59 
 
 
200 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0097  cytochrome c class I  38.46 
 
 
187 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.340864  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2077  cytochrome c class I  43.18 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3385  cytochrome c class I  50.6 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  37.25 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  34.09 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02300  hypothetical protein  43.01 
 
 
324 aa  65.1  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003470  cytochrome c oxidase subunit CcoP  41.94 
 
 
324 aa  63.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.204703  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19980  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  42.35 
 
 
306 aa  61.6  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0775  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  31.21 
 
 
374 aa  61.2  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0709529  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0781  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.06 
 
 
382 aa  61.2  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.279912  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1234  cytochrome c class I  41.56 
 
 
163 aa  61.6  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5253  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2419  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.89 
 
 
298 aa  61.2  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.203271  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1992  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  40.87 
 
 
323 aa  60.5  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1845  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  40 
 
 
349 aa  60.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2513  cytochrome c family protein  31.85 
 
 
146 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1200  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.78 
 
 
307 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944048  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1566  diheme cytochrome c  32.74 
 
 
324 aa  59.7  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1279  cytochrome C oxidase subunit III  36.67 
 
 
326 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.55862 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1107  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.67 
 
 
307 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.1867  normal  0.890058 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0462  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  41.25 
 
 
294 aa  59.3  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528353  normal  0.120204 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3043  cytochrome c class I  40.26 
 
 
163 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  44.12 
 
 
530 aa  59.3  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0936  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.78 
 
 
321 aa  58.5  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1050  cytochrome c oxidase, subunit CcoP  37.25 
 
 
326 aa  58.2  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.26248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3273  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  40.85 
 
 
293 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0716  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  42.31 
 
 
299 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000848569  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1809  cytochrome c class I  37.14 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0990  cytochrome c, class I  38.89 
 
 
159 aa  57.4  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2041  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  41.46 
 
 
304 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112855  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5322  cytochrome c class I  29.25 
 
 
346 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0021785  normal  0.0885214 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1140  cytochrome c, mono- and diheme variant  32.56 
 
 
269 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000421025  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1787  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.24 
 
 
296 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.832372  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1529  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.57 
 
 
296 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0632  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.96 
 
 
311 aa  55.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1152  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.82 
 
 
307 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.67748  normal  0.0615842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2794  cytochrome-c oxidase fixP chain  38.03 
 
 
290 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40028  normal  0.764362 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1963  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.69 
 
 
299 aa  55.1  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3572  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  43.16 
 
 
313 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3819  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  42.11 
 
 
313 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.718495 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1583  cytochrome c class I  33.7 
 
 
152 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.889837  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1280  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  43.48 
 
 
296 aa  55.1  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2114  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.03 
 
 
293 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5233  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.03 
 
 
293 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558245  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0957  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.56 
 
 
723 aa  54.7  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2070  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.37 
 
 
317 aa  54.7  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2038  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  41.46 
 
 
304 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645844  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0640  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  34.04 
 
 
317 aa  54.3  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00144389  normal  0.731744 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1903  hypothetical protein  41.54 
 
 
110 aa  54.3  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172183  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  39.51 
 
 
308 aa  53.9  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0017  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.97 
 
 
293 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3576  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  43.16 
 
 
326 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1827  cytochrome c, class I  31.46 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2538  cytochrome c, class I  37.18 
 
 
313 aa  53.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0341  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  32.11 
 
 
306 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0261936 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  39.51 
 
 
312 aa  53.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1236  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  35.63 
 
 
286 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.385578  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0012  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  42.25 
 
 
293 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2607  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.95 
 
 
332 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00078494  normal  0.780558 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3416  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  36 
 
 
325 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  40 
 
 
313 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05464  cytochrome c  26.98 
 
 
718 aa  51.6  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3041  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  33.33 
 
 
286 aa  51.6  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4258  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  40 
 
 
325 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.816603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1610  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  40 
 
 
325 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00269268  hitchhiker  0.0066634 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2602  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  39.18 
 
 
308 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000191523  normal  0.411563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1820  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  38.61 
 
 
327 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.700431  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0733  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.71 
 
 
293 aa  51.2  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38 
 
 
318 aa  50.8  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.04222  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2214  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  39.13 
 
 
322 aa  50.8  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0014  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.62 
 
 
293 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2575  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.02 
 
 
307 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3823  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  40 
 
 
325 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85561  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2042  cytochrome c, class I  31.46 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1615  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.54 
 
 
313 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0748863  normal  0.0271548 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2486  cytochrome c class I  35.44 
 
 
266 aa  50.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.148102 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0634  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  39.08 
 
 
304 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1794  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  41.33 
 
 
325 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.448855  normal  0.0580758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2422  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  39.13 
 
 
325 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000195931  hitchhiker  0.0000802746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1913  hypothetical protein  36.36 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000530569  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  30.23 
 
 
381 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0693  Cbb3-type cytochrome c oxidase CcoP subunit  30 
 
 
290 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1172  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  33.01 
 
 
339 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3854  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.23 
 
 
292 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2348  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30 
 
 
290 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.765339  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4630  cytochrome c class I  32.22 
 
 
204 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.881109 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3780  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  37.89 
 
 
318 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  32.61 
 
 
546 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4516  cytochrome c class I  32.22 
 
 
197 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0581555  normal  0.874562 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44400  putative cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.89 
 
 
318 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3661  hypothetical protein  28.85 
 
 
132 aa  49.3  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4148  cytochrome c class I  32.22 
 
 
205 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.967829  normal  0.37393 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1333  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  33.01 
 
 
339 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1231  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  33.01 
 
 
339 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>