28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2259 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2259  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  496  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0461584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2534  protein of unknown function DUF1457  100 
 
 		 206 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2216  protein of unknown function DUF1457  90.29 
 
 		 206 aa  350  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.196388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4633  hypothetical protein  60.29 
 
 		 199 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5126  protein of unknown function DUF1457  60.68 
 
 		 197 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3233  hypothetical protein  60.59 
 
 		 196 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0930  hypothetical protein  37.27 
 
 		 216 aa  121  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.432355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  37.38 
 
 		 200 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1724  hypothetical protein  37.56 
 
 		 209 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3899  protein of unknown function DUF1457  39.53 
 
 		 189 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3273  hypothetical protein  42.07 
 
 		 186 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00114404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  39.53 
 
 		 184 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2151  hypothetical protein  37.71 
 
 		 186 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0990519  normal  0.164648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  36.36 
 
 		 223 aa  98.2  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1318  hypothetical protein  40.85 
 
 		 185 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5216  hypothetical protein  37.93 
 
 		 185 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1854  protein of unknown function DUF1457  35.29 
 
 		 205 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142291  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2054  protein of unknown function DUF1457  33.55 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1936  hypothetical protein  35.4 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1646  hypothetical protein  47.3 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1258  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1219  hypothetical protein  32.78 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1076  hypothetical protein  34.78 
 
 		 186 aa  72  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00643993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3746  hypothetical protein  28.49 
 
 		 182 aa  52.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0768901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3935  hypothetical protein  35.46 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2442  hypothetical protein  44.12 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000723195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0103  hypothetical protein  32.1 
 
 		 166 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147246 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1268  hypothetical protein  38.46 
 
 		 315 aa  43.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>