57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1134 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1134  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  821    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1246  hypothetical protein  99.51 
 
 		 411 aa  818    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.422175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1278  hypothetical protein  93.92 
 
 		 411 aa  719    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0373  hypothetical protein  73.56 
 
 		 416 aa  587  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3508  hypothetical protein  72.99 
 
 		 411 aa  587  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4644  hypothetical protein  47.69 
 
 		 410 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.844377 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3727  hypothetical protein  46.23 
 
 		 410 aa  340  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.291811 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1399  hypothetical protein  24.87 
 
 		 384 aa  97.1  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2152  hypothetical protein  26.2 
 
 		 419 aa  95.5  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0275  hypothetical protein  27.71 
 
 		 582 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1326  hypothetical protein  26.9 
 
 		 584 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.157245  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1166  hypothetical protein  26.9 
 
 		 584 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.981297  normal  0.431954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3603  hypothetical protein  26.81 
 
 		 489 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158182 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0145  hypothetical protein  25.57 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.955464  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0503  hypothetical protein  25.29 
 
 		 478 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1389  hypothetical protein  25.57 
 
 		 519 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0998  hypothetical protein  25.39 
 
 		 521 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2312  hypothetical protein  25.39 
 
 		 516 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  24.19 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5234  hypothetical protein  22.88 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1084  hypothetical protein  25.39 
 
 		 521 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1740  hypothetical protein  23.3 
 
 		 443 aa  54.3  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130481  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  26.57 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4221  hypothetical protein  27.4 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.287374  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  26.2 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0644  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.89 
 
 		 425 aa  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0200148  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  25.62 
 
 		 405 aa  49.7  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  28.48 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  24.01 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.58 
 
 		 663 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.72 
 
 		 430 aa  47  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  26.46 
 
 		 395 aa  46.6  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  24.29 
 
 		 456 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  28.39 
 
 		 314 aa  46.6  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  27.3 
 
 		 411 aa  46.6  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1379  secretion protein HlyD family protein  22.49 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  24.74 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.65 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1853  multidrug resistance transmembrane protein  24.62 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.104689 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3638  secretion protein HlyD family protein  32.77 
 
 		 503 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  32.5 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  24.74 
 
 		 387 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  27.1 
 
 		 375 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  27.98 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  31.03 
 
 		 316 aa  44.3  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  24 
 
 		 349 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 316 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  27.63 
 
 		 360 aa  44.3  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.55 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1144  secretion protein HlyD family protein  25.21 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143245  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  25.72 
 
 		 413 aa  43.9  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  25.37 
 
 		 352 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  26.32 
 
 		 288 aa  43.5  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  31.17 
 
 		 302 aa  43.5  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  26.32 
 
 		 393 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  24.03 
 
 		 288 aa  43.5  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  25.79 
 
 		 343 aa  42.7  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>