83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0799 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0799  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 		 74 aa  149  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.362297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2465  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  67.12 
 
 		 329 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5387  alcohol dehydrogenase  65.75 
 
 		 329 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3549  alcohol dehydrogenase  65.75 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269261 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  65.75 
 
 		 329 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  65.75 
 
 		 329 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  65.75 
 
 		 329 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5850  alcohol dehydrogenase  64.79 
 
 		 328 aa  97.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2299  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  64.29 
 
 		 329 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.830283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  56.34 
 
 		 329 aa  90.1  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  62.86 
 
 		 330 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.805863 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0387  quinone oxidoreductase  57.75 
 
 		 329 aa  88.6  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665371  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5322  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.3 
 
 		 329 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0465  hypothetical protein  53.52 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01925  quinone oxidoreductase  55.07 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805779  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2454  alcohol dehydrogenase  54.93 
 
 		 330 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0216  hypothetical protein  52.11 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2576  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.11 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0310656  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1377  hypothetical protein  52.11 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0629  hypothetical protein  52.11 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2804  hypothetical protein  52.11 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849843  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3238  hypothetical protein  52.11 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1273  putative oxidoreductase  46.48 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0445  hypothetical protein  49.3 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.52 
 
 		 332 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.770157  normal  0.0417244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3217  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.72 
 
 		 326 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4323  putative oxidoreductase, zinc-containing alcohol dehydrogenase  53.03 
 
 		 333 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1835  alcohol dehydrogenase  40.85 
 
 		 329 aa  67.4  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.38 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5990  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.67 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3336  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.84 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2622  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 		 323 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.945187  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 327 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  40.79 
 
 		 335 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3890  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.4 
 
 		 337 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1054  alcohol dehydrogenase  55.26 
 
 		 332 aa  47.8  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.67 
 
 		 331 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3201  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.8 
 
 		 324 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  36.49 
 
 		 329 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4760  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.62 
 
 		 336 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000489958  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4634  alcohol dehydrogenase  47.62 
 
 		 336 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325342  hitchhiker  0.00283653 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.63 
 
 		 332 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0924  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50 
 
 		 334 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0958  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50 
 
 		 334 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761885  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4772  alcohol dehydrogenase  47.62 
 
 		 336 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.14 
 
 		 333 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  37.5 
 
 		 327 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2747  putative oxidoreductase  50 
 
 		 339 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4470  alcohol dehydrogenase  47.37 
 
 		 325 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0103957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.62 
 
 		 332 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.29 
 
 		 339 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0858  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.44 
 
 		 332 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32420  putative oxidoreductase  53.12 
 
 		 339 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4281  alcohol dehydrogenase  36.49 
 
 		 344 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.672706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2527  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.58 
 
 		 323 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  46.15 
 
 		 323 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  45.95 
 
 		 327 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1425  alcohol dehydrogenase  46.34 
 
 		 339 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0660  alcohol dehydrogenase  47.62 
 
 		 336 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179188  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.29 
 
 		 322 aa  41.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3282  alcohol dehydrogenase  40.91 
 
 		 333 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1575  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.59 
 
 		 336 aa  41.6  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  51.35 
 
 		 326 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1832  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.29 
 
 		 331 aa  41.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.612852  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07194  quinone oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02090)  51.52 
 
 		 336 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4983  quinone oxidoreductase putative PIG3  42.86 
 
 		 325 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1421  alcohol dehydrogenase  50 
 
 		 328 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.329705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  48.57 
 
 		 331 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  47.37 
 
 		 332 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5041  alcohol dehydrogenase  36.17 
 
 		 323 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.750804  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0913  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  48.72 
 
 		 328 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0131994 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4404  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  45.95 
 
 		 337 aa  40.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.880778 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  46.15 
 
 		 342 aa  40.8  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.18 
 
 		 338 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0261  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family  42.22 
 
 		 324 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1088  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  50 
 
 		 328 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3513  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  47.62 
 
 		 332 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  46.15 
 
 		 336 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.71 
 
 		 332 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  32.91 
 
 		 389 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  46.15 
 
 		 336 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  46.15 
 
 		 336 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.71 
 
 		 332 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>