More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0338 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0583  glutamyl-tRNA synthetase  84.32 
 
 		 555 aa  996    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153403  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0338  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 555 aa  1134    Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00104311  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1648  glutamyl-tRNA synthetase  84.5 
 
 		 555 aa  998    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0253  glutamyl-tRNA synthetase  85.05 
 
 		 555 aa  999    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.672703  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1110  glutamyl-tRNA synthetase  71.45 
 
 		 561 aa  824    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2885  glutamyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 561 aa  527  1e-148  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2371  glutamyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 562 aa  522  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0747  glutamyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 560 aa  520  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.152581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1817  glutamyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 561 aa  514  1e-144  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.183572  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0091  glutamyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 557 aa  476  1e-133  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2208  glutamyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 634 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.387382  normal  0.932733 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2335  glutamyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 569 aa  433  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000111665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1470  glutamyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 571 aa  429  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000234189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1756  glutamyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 570 aa  422  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0371  glutamyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 570 aa  420  1e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1411 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1338  glutamyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 570 aa  414  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162859  normal  0.450073 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0816  glutamyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 569 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1137  glutamyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 570 aa  403  1e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.215502 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1466  glutamyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 564 aa  398  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1069  glutamyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 574 aa  379  1e-104  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0462045  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0445  glutamyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 		 573 aa  369  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1533  glutamyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 588 aa  364  2e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.403992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2537  glutamyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 574 aa  350  3e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2131  glutamyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 		 566 aa  347  2e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000159948  hitchhiker  0.0000949008 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2071  glutamyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 		 582 aa  335  1e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2322  glutamyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 		 590 aa  322  8e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2609  glutamyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 		 579 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0311  glutamyl-tRNA synthetase  32.93 
 
 		 569 aa  278  2e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.396423 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51430  glutamate-trna ligase  29.96 
 
 		 523 aa  203  6e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00070  glutamate-tRNA ligase, putative  30.47 
 
 		 728 aa  203  7e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89978  glutamine-tRNA ligase  29.09 
 
 		 720 aa  203  8e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.220095 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  29.85 
 
 		 555 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 556 aa  197  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  32.88 
 
 		 587 aa  196  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39738  predicted protein  34.23 
 
 		 749 aa  196  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  29.3 
 
 		 568 aa  195  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 		 556 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72287  glutaminyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 		 799 aa  191  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.579144  normal  0.826623 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1902  glutaminyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 		 590 aa  190  7e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000991205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  30.6 
 
 		 557 aa  189  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  27.97 
 
 		 576 aa  189  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 		 556 aa  189  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  32.43 
 
 		 552 aa  186  7e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 		 556 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 		 552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  31.68 
 
 		 552 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 		 548 aa  183  8.000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 556 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 		 582 aa  182  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2413  glutaminyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 		 556 aa  182  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000218793  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  29.4 
 
 		 563 aa  182  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00740  glutamine-tRNA ligase, putative  27.21 
 
 		 858 aa  181  4e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  28.13 
 
 		 556 aa  181  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0137132  hitchhiker  0.0018216 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  30.36 
 
 		 556 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  28.13 
 
 		 556 aa  181  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 		 554 aa  180  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1482  glutaminyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 		 556 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 		 554 aa  180  7e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 		 554 aa  180  7e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  26.95 
 
 		 554 aa  180  7e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 		 554 aa  180  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 		 554 aa  180  7e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 		 554 aa  180  7e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  27.52 
 
 		 559 aa  179  8e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  30.13 
 
 		 555 aa  179  9e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2571  glutaminyl-tRNA synthetase  28.13 
 
 		 556 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838936  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 		 554 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2689  glutaminyl-tRNA synthetase  27.5 
 
 		 556 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00133273  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 		 554 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3294  glutaminyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 565 aa  178  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000133432  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 		 561 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3240  glutaminyl-tRNA synthetase  28.83 
 
 		 556 aa  178  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00746606  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  28.45 
 
 		 561 aa  178  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  26.39 
 
 		 552 aa  178  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  27.47 
 
 		 553 aa  178  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 		 554 aa  177  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  28.22 
 
 		 557 aa  177  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 564 aa  177  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  26.12 
 
 		 555 aa  177  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  26.12 
 
 		 555 aa  176  7e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 		 569 aa  176  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 568 aa  176  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 555 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 555 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 		 558 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1786  glutaminyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 		 556 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 569 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 		 555 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 		 555 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 555 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 558 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 		 555 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6655  glutaminyl-tRNA synthetase  29.01 
 
 		 583 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204769  normal  0.445852 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1533  glutaminyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 		 556 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.208966  normal  0.486812 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 		 570 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 		 552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  27.15 
 
 		 554 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 		 555 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  28.79 
 
 		 555 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 		 559 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>