More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1776 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1776  FeS assembly scaffold SufA  100 
 
 
128 aa  263  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641899  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  71.2 
 
 
126 aa  188  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0934  hesb protein  71.2 
 
 
168 aa  187  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2101  FeS assembly scaffold SufA  72.95 
 
 
130 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2247  FeS assembly scaffold SufA  72.27 
 
 
126 aa  185  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453155  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2442  FeS assembly scaffold SufA  72.95 
 
 
128 aa  184  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1894  FeS assembly scaffold SufA  72.36 
 
 
130 aa  183  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334137  hitchhiker  0.00505979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  72.88 
 
 
130 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  55.83 
 
 
126 aa  141  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  55.83 
 
 
126 aa  141  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0616  putative FeS assembly scaffold SufA  57.39 
 
 
119 aa  140  4e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.25627  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2835  HesB/YadR/YfhF  58.26 
 
 
134 aa  139  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0518728  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3971  Iron-sulfur cluster assembly protein  55.65 
 
 
134 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0542987  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2748  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.26 
 
 
123 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.51933  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  53.72 
 
 
126 aa  134  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  52.5 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3982  FeS assembly scaffold SufA  52.5 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2209  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.33 
 
 
119 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  53.1 
 
 
141 aa  130  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2323  HesB/YadR/YfhF  53.91 
 
 
134 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1659  HesB/YadR/YfhF  53.04 
 
 
134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2988  HesB/YadR/YfhF  53.04 
 
 
134 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0481576 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1948  hypothetical protein  49.55 
 
 
118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2525  HesB/YadR/YfhF  50 
 
 
126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00201416  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.25 
 
 
125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0103  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0599  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.65 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2461  FeS assembly scaffold SufA  51.3 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0344  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.65 
 
 
118 aa  124  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3257  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.56 
 
 
119 aa  124  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319112  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0765  HesB/YadR/YfhF  50.93 
 
 
117 aa  123  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.593205 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.67 
 
 
130 aa  121  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1321  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.55 
 
 
119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  0.902346 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.95 
 
 
123 aa  110  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2349  putative iron-binding protein iscA  47.22 
 
 
121 aa  110  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0909785  normal  0.541435 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
109 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.28 
 
 
110 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.28 
 
 
110 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  54.12 
 
 
110 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0824  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.14 
 
 
107 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0263078  normal  0.761008 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0675  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.14 
 
 
107 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2266  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.57 
 
 
123 aa  100  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.061086  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1694  FeS assembly scaffold SufA  41.67 
 
 
124 aa  99  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.894129  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  43.14 
 
 
107 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0250  HesB/YadR/YfhF family protein  42.86 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2752  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  42.86 
 
 
123 aa  98.2  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203289  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1658  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.75 
 
 
106 aa  97.8  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.502559  hitchhiker  0.000512708 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0719  iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  40 
 
 
107 aa  97.4  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669917  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1479  HesB/YadR/YfhF family protein  41.75 
 
 
106 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0188943 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.12 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3625  iron-sulfur cluster assembly protein  41.9 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.655244  normal  0.813193 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1491  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.95 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1778  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.16 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000335505 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1823  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.15 
 
 
119 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1795  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.15 
 
 
119 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2813  iron-sulfur cluster assembly protein  41.9 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0693876  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02420  iron-sulfur cluster assembly protein  41.9 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1140  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.960309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1958  FeS assembly scaffold SufA  42.86 
 
 
122 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1900  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  42.86 
 
 
122 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00343676  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02384  hypothetical protein  41.9 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2681  iron-sulfur cluster assembly protein  41.9 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3760  iron-sulfur cluster assembly protein  41.9 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1512  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  42.86 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.613929  hitchhiker  0.00000225321 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2398  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  42.86 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029716 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2679  iron-sulfur cluster assembly protein  41.9 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1149  iron-sulfur cluster assembly protein  41.9 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0396578  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2903  iron-sulfur cluster assembly protein  41.9 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.193347  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  44.12 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1765  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  42.86 
 
 
122 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.718916  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3025  iron-sulfur cluster assembly protein  40.95 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.116903  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11154  predicted protein  42.86 
 
 
105 aa  95.1  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1885  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  42.86 
 
 
122 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1631  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  37.86 
 
 
106 aa  94  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.017999  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0471  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.95 
 
 
107 aa  94  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0506099  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2450  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  40.95 
 
 
123 aa  94  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.121814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01057  hypothetical protein  40.2 
 
 
107 aa  94  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3315  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.62 
 
 
126 aa  94  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0790107 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40380  Iron-sulfur biogenesis protein  41.9 
 
 
107 aa  93.6  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2803  iron-sulfur cluster assembly protein  40.95 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1106  iron-sulfur cluster assembly protein  40.95 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0886041  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2696  iron-sulfur cluster assembly protein  40.95 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2781  iron-sulfur cluster assembly protein  40.95 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0806  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.16 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00435641  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2915  iron-sulfur cluster assembly protein  40.95 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2057  iron-sulfur cluster assembly protein  40.95 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0583672  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2109  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.53 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2215  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.05 
 
 
107 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4334  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1706  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.05 
 
 
107 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.463089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1239  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  40.95 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2597  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.05 
 
 
107 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2731  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.05 
 
 
107 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2653  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.05 
 
 
107 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54259  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1487  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.05 
 
 
107 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28627  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1877  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.05 
 
 
107 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0201  HesB/YadR/YfhF  39.25 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3105  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.05 
 
 
107 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172201  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0279  HesB/YadR/YfhF family protein  38.1 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00587382  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2445  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.300922  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>