80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1786 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1786  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
246 aa  506  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.350828 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1387  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  58.13 
 
 
249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00099914  normal  0.234758 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2608  hypothetical protein  54.22 
 
 
268 aa  279  3e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6771  hypothetical protein  39.18 
 
 
248 aa  194  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3794  hypothetical protein  36.51 
 
 
275 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332323  normal  0.0189653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.71 
 
 
284 aa  156  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00497597 
 
 
-
 
NC_004310  BR0346  hypothetical protein  36.9 
 
 
272 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.134093  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0362  hypothetical protein  36.9 
 
 
272 aa  152  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0448  hypothetical protein  35.71 
 
 
278 aa  149  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3472  hypothetical protein  37.15 
 
 
276 aa  148  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.489268  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08180  hypothetical protein  35.63 
 
 
280 aa  148  9e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.874298  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3011  hypothetical protein  39.22 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0659197  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0205  hypothetical protein  36.51 
 
 
278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5329  hypothetical protein  38.43 
 
 
278 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.71 
 
 
253 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.199171  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3172  hypothetical protein  38.16 
 
 
271 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535542  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4787  hypothetical protein  37.99 
 
 
278 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133323  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3330  hypothetical protein  37.99 
 
 
278 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0228247 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7819  hypothetical protein  35.32 
 
 
278 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0211  hypothetical protein  37.99 
 
 
278 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5420  hypothetical protein  37.99 
 
 
278 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5442  hypothetical protein  37.99 
 
 
278 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4827  hypothetical protein  37.99 
 
 
278 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.576773 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4304  hypothetical protein  36.68 
 
 
278 aa  141  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.208475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5334  hypothetical protein  38.43 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3034  hypothetical protein  36.9 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.432048  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3295  hypothetical protein  37.99 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3200  hypothetical protein  36.36 
 
 
289 aa  139  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228169  normal  0.637752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2830  hypothetical protein  35.37 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2030  allantoin catabolism protein  37.39 
 
 
271 aa  139  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3617  hypothetical protein  37.12 
 
 
278 aa  138  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1325  hypothetical protein  35.69 
 
 
280 aa  138  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0226639  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1072  hypothetical protein  36.68 
 
 
279 aa  139  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278788  normal  0.0185429 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49650  hypothetical protein  36.68 
 
 
278 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.473389  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4237  hypothetical protein  36.68 
 
 
278 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3098  allantoin catabolism protein  33.33 
 
 
261 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0616  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0553  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1553  hypothetical protein  36.51 
 
 
278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1741  hypothetical protein  35.48 
 
 
279 aa  136  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00465  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  135  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0560  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  135  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00470  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  135  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0079  hypothetical protein  34.78 
 
 
282 aa  136  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3108  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  135  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.520209 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1921  hypothetical protein  34.39 
 
 
278 aa  135  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0555  hypothetical protein  36.96 
 
 
279 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2060  hypothetical protein  35.08 
 
 
279 aa  135  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0117178 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6664  hypothetical protein  36.21 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00516575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0633  hypothetical protein  32.48 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0574  hypothetical protein  32.48 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0589  hypothetical protein  32.91 
 
 
261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0241  hypothetical protein  32.81 
 
 
277 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0572  hypothetical protein  32.48 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0579  hypothetical protein  32.48 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.855495 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2601  hypothetical protein  34.39 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.119813  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3214  hypothetical protein  35.37 
 
 
270 aa  131  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5757  hypothetical protein  35.78 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5006  hypothetical protein  35.37 
 
 
274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2487  hypothetical protein  35.81 
 
 
278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0929015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3435  hypothetical protein  35.37 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2396  hypothetical protein  35.37 
 
 
278 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.737785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3530  hypothetical protein  35.37 
 
 
278 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660502  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2243  hypothetical protein  35.37 
 
 
311 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9431  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5701  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.95 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0787064  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  33.33 
 
 
185 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  33.33 
 
 
185 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  33.33 
 
 
185 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  31.94 
 
 
185 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  33.33 
 
 
185 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  33.33 
 
 
185 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  27.56 
 
 
188 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.06 
 
 
332 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2919  transcriptional regulator, XRE family  27.88 
 
 
170 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 
185 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1306  transcriptional regulator, XRE family  27.88 
 
 
170 aa  43.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.38 
 
 
118 aa  42.7  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  37.14 
 
 
129 aa  42.4  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  30.56 
 
 
185 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  31.94 
 
 
185 aa  42  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>