40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1395 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1395  YceI family protein  100 
 
 		 174 aa  351  4e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.187267  normal  0.0429317 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2164  YceI family protein  60.38 
 
 		 177 aa  206  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4883  YceI family protein  29.45 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.831843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3103  hypothetical protein  24.32 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0053  YceI family protein  27.92 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3289  YceI family protein  30.08 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  24.41 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0433  YceI family protein  27.16 
 
 		 202 aa  51.6  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0486569  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4138  YceI family protein  25.48 
 
 		 186 aa  51.6  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  27.84 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  27.84 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  27.84 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  33.33 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  28.09 
 
 		 190 aa  48.5  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  32.29 
 
 		 223 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  33.06 
 
 		 181 aa  47.8  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  29.37 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  39.34 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2314  YceI family protein  21.43 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  31.25 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  28.35 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  37.29 
 
 		 182 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  28.46 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  26.6 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  28.91 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  28.33 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  26.37 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3521  YceI family protein  25.89 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.761218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  27.56 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0225  YceI family protein  23.03 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  24.74 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0167  hypothetical protein  22.73 
 
 		 181 aa  41.6  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  29.93 
 
 		 420 aa  42  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  24.74 
 
 		 192 aa  41.6  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  28.57 
 
 		 182 aa  41.6  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2435  YceI family protein  32.93 
 
 		 188 aa  41.2  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.832405  normal  0.0582212 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3300  YceI family protein  25.77 
 
 		 186 aa  41.2  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.607855 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  35.48 
 
 		 201 aa  41.2  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0734  YceI family protein  24.43 
 
 		 241 aa  40.8  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28440  hypothetical protein  21.43 
 
 		 229 aa  40.8  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.533417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>