More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1817 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1817  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 561 aa  1152    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.183572  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0747  glutamyl-tRNA synthetase  60.43 
 
 		 560 aa  738    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.152581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2885  glutamyl-tRNA synthetase  60.36 
 
 		 561 aa  712    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2208  glutamyl-tRNA synthetase  61.3 
 
 		 634 aa  640    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.387382  normal  0.932733 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2371  glutamyl-tRNA synthetase  63.52 
 
 		 562 aa  754    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1110  glutamyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 561 aa  535  1e-150  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0253  glutamyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 555 aa  525  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.672703  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0583  glutamyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 555 aa  522  1e-147  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153403  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1648  glutamyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 555 aa  521  1e-146  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0338  glutamyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 555 aa  514  1e-144  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00104311  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0091  glutamyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 557 aa  493  9.999999999999999e-139  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1466  glutamyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 564 aa  489  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2335  glutamyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 569 aa  475  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000111665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1470  glutamyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 571 aa  458  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000234189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0445  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 573 aa  406  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0816  glutamyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 569 aa  389  1e-107  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1069  glutamyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 574 aa  389  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0462045  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0371  glutamyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 570 aa  384  1e-105  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1411 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1338  glutamyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 570 aa  380  1e-104  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.162859  normal  0.450073 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2322  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 590 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2537  glutamyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 574 aa  379  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1137  glutamyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 570 aa  372  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.215502 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2071  glutamyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 582 aa  372  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1533  glutamyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 588 aa  370  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.403992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1756  glutamyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 		 570 aa  369  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2609  glutamyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 579 aa  359  7e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2131  glutamyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 		 566 aa  349  7e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000159948  hitchhiker  0.0000949008 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0311  glutamyl-tRNA synthetase  30.03 
 
 		 569 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.396423 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89978  glutamine-tRNA ligase  29.5 
 
 		 720 aa  206  1e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.220095 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  29.77 
 
 		 556 aa  201  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72287  glutaminyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 		 799 aa  197  3e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.579144  normal  0.826623 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  30.21 
 
 		 552 aa  197  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1902  glutaminyl-tRNA synthetase  33.5 
 
 		 590 aa  196  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000991205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 556 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39738  predicted protein  30.46 
 
 		 749 aa  195  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  29.82 
 
 		 565 aa  193  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  32.7 
 
 		 568 aa  192  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 		 569 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  29.89 
 
 		 556 aa  190  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1270  glutaminyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 		 551 aa  190  8e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 		 565 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2615  glutaminyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 556 aa  188  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09157  Glutaminyl-tRNA synthetase (Eurofung)  28.35 
 
 		 628 aa  188  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1269  glutaminyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 		 551 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1482  glutaminyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 		 556 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 		 587 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 		 568 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 		 555 aa  187  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1585  glutaminyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 571 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000343871  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2758  glutaminyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 556 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112039  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 		 556 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00615688  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 		 556 aa  187  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 557 aa  187  6e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 555 aa  186  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3294  glutaminyl-tRNA synthetase  30.26 
 
 		 565 aa  186  8e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000133432  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 		 556 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1619  glutaminyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 		 556 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51430  glutamate-trna ligase  27.7 
 
 		 523 aa  184  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  28.94 
 
 		 555 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2188  glutaminyl-tRNA synthetase  31.56 
 
 		 816 aa  185  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00249648  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  30.31 
 
 		 567 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  28.94 
 
 		 555 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  31.38 
 
 		 563 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  28.94 
 
 		 555 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 		 556 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0137132  hitchhiker  0.0018216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2571  glutaminyl-tRNA synthetase  29.98 
 
 		 556 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838936  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  30.31 
 
 		 567 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2689  glutaminyl-tRNA synthetase  29.06 
 
 		 556 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00133273  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  30.79 
 
 		 580 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 		 567 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  30.08 
 
 		 552 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 		 559 aa  183  6e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  30.08 
 
 		 552 aa  183  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00740  glutamine-tRNA ligase, putative  29.05 
 
 		 858 aa  183  8.000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 		 565 aa  183  9.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1786  glutaminyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 556 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 		 555 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 		 555 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 		 555 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 		 555 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2413  glutaminyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 		 556 aa  182  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000218793  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 		 555 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 		 558 aa  182  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  28.4 
 
 		 548 aa  182  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 		 570 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  29.37 
 
 		 552 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  31.23 
 
 		 572 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 		 564 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 		 556 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23867  predicted protein  29.53 
 
 		 541 aa  180  7e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  28.94 
 
 		 554 aa  179  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_002950  PG1951  glutaminyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 		 566 aa  178  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 		 552 aa  178  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 567 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1533  glutaminyl-tRNA synthetase  28.87 
 
 		 556 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.208966  normal  0.486812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 555 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00070  glutamate-tRNA ligase, putative  25.97 
 
 		 728 aa  177  5e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  28.97 
 
 		 552 aa  177  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 		 554 aa  176  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  28.06 
 
 		 552 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>