51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1722 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1722  putative UV damage endonuclease  100 
 
 		 301 aa  620  1e-177  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3012  UV-endonuclease UvdE  38.49 
 
 		 420 aa  220  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.295167 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2329  putative UV damage endonuclease  32.89 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.385133  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2043  putative UV damage endonuclease  32.56 
 
 		 412 aa  202  8e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1671  putative UV damage endonuclease  37.5 
 
 		 321 aa  196  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00771336  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1549  UV-endonuclease UvdE  32.65 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09690  UV-damage endonuclease  34.36 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1958  putative UV damage endonuclease  34.88 
 
 		 321 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5478  putative UV damage endonuclease  30.41 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5525  putative UV damage endonuclease  30.07 
 
 		 325 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5196  putative UV damage endonuclease  29.73 
 
 		 325 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5031  putative UV damage endonuclease  29.73 
 
 		 317 aa  168  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5440  putative UV damage endonuclease  29.73 
 
 		 325 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5145  putative UV damage endonuclease  29.79 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5047  putative UV damage endonuclease  29.39 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.43469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0352  putative UV damage endonuclease  35 
 
 		 320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5482  putative UV damage endonuclease  29.71 
 
 		 317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00076695  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5470  putative UV damage endonuclease  30.91 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000392021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5592  putative UV damage endonuclease  29.39 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0174  putative UV damage endonuclease  40.91 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2026  UV-endonuclease UvdE  37.45 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200241  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00604  endonuclease (Eurofung)  34.11 
 
 		 591 aa  146  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0222  putative UV damage endonuclease  32.3 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0248  putative UV damage endonuclease  32.3 
 
 		 320 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0226  putative UV damage endonuclease  31.52 
 
 		 320 aa  142  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0220  putative UV damage endonuclease  32.3 
 
 		 320 aa  142  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0261  putative UV damage endonuclease  32.3 
 
 		 320 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0234  putative UV damage endonuclease  32.3 
 
 		 320 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0263  putative UV damage endonuclease  31.13 
 
 		 320 aa  142  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1346  putative UV damage endonuclease  31.99 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0268  putative UV damage endonuclease  31.91 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5061  putative UV damage endonuclease  31.13 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0282  putative UV damage endonuclease  31.91 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2424  UV-endonuclease UvdE  35.69 
 
 		 353 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03600  conserved hypothetical protein  35.06 
 
 		 612 aa  139  4.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.574638  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2305  UV-endonuclease UvdE  33.11 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0136  putative UV damage endonuclease  36.68 
 
 		 225 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4123  putative UV damage endonuclease  30.51 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0383  UV damage repair endonuclease-like protein  29.61 
 
 		 293 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0127865  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3025  putative UV damage endonuclease  31.78 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2319  UV damage repair endonuclease-like protein  30.93 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1694  UV damage repair endonuclease-like protein  32.68 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0573  putative UV damage endonuclease  30 
 
 		 315 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280192  normal  0.431721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1816  UV damage repair endonuclease  29.95 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059052  normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1707  UV damage repair endonuclease  30.1 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0239219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1536  UV damage repair endonuclease  29.95 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6817  UV damage repair endonuclease  26.5 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1819  putative UV damage endonuclease  30.77 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.594158 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2133  UV damage repair endonuclease  29.34 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  0.466844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3654  UV damage repair endonuclease-like protein  26.32 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1775  hypothetical protein  28.57 
 
 		 57 aa  48.9  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000133943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>