More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2482 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2482  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
284 aa  588  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2206  methionine aminopeptidase, type I  98.94 
 
 
284 aa  584  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2162  methionine aminopeptidase, type I  97.13 
 
 
279 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0586  methionine aminopeptidase, type I  88.48 
 
 
275 aa  502  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.487821  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7508  methionine aminopeptidase, type I  82.72 
 
 
274 aa  475  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6761  methionine aminopeptidase, type I  82.42 
 
 
274 aa  473  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2076  methionine aminopeptidase, type I  71.7 
 
 
277 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2897  methionine aminopeptidase, type I  66.91 
 
 
277 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1710  methionine aminopeptidase  70.24 
 
 
278 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2600  methionine aminopeptidase, type I  69.05 
 
 
273 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0881551  normal  0.201576 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1455  methionine aminopeptidase  67.57 
 
 
274 aa  371  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.519958  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1458  methionine aminopeptidase  70.63 
 
 
279 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00203413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1512  methionine aminopeptidase  68.25 
 
 
278 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1282  methionine aminopeptidase  67.46 
 
 
275 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00202985  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1245  methionine aminopeptidase  67.46 
 
 
299 aa  365  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12762  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1910  methionine aminopeptidase  66.8 
 
 
275 aa  364  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.529497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1044  methionine aminopeptidase, type I  66.67 
 
 
279 aa  363  2e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3053  methionine aminopeptidase, type I  64.09 
 
 
275 aa  360  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0172083  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0155  methionine aminopeptidase, type I  61.98 
 
 
274 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.368202  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3793  methionine aminopeptidase, type I  60.73 
 
 
276 aa  352  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0861362  unclonable  0.000000166393 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0431  methionine aminopeptidase, type I  62.36 
 
 
274 aa  352  5e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0336  peptidase M24A  63.32 
 
 
271 aa  350  1e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.575724  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0058  methionine aminopeptidase, type I  61.39 
 
 
274 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0392  methionine aminopeptidase, type I  61.39 
 
 
274 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2271  methionine aminopeptidase  62.55 
 
 
278 aa  348  6e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0578  methionine aminopeptidase, type I  62.36 
 
 
273 aa  348  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1110  methionine aminopeptidase, type I  63.49 
 
 
283 aa  343  2e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.249356  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7381  methionine aminopeptidase, type I  59.02 
 
 
274 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0733  methionine aminopeptidase, type I  62.74 
 
 
271 aa  333  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.801618  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0829  methionine aminopeptidase  64.61 
 
 
276 aa  333  2e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0450293  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0378  methionine aminopeptidase, type I  61.51 
 
 
279 aa  324  1e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  61.51 
 
 
263 aa  323  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4833  methionine aminopeptidase, type I  60.71 
 
 
279 aa  322  5e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1644  methionine aminopeptidase, type I  56.46 
 
 
274 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828935  normal  0.0725302 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  57.25 
 
 
261 aa  305  7e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0285  methionine aminopeptidase, type I  57.94 
 
 
269 aa  301  9e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0117  methionine aminopeptidase, type I  58.54 
 
 
271 aa  300  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2993  methionine aminopeptidase, type I  57.14 
 
 
293 aa  298  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0922549 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0923  methionine aminopeptidase, type I  57.14 
 
 
293 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2582  methionine aminopeptidase, type I  57.14 
 
 
293 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2469  methionine aminopeptidase, type I  56.91 
 
 
271 aa  296  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.76233  normal  0.0281662 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  56.33 
 
 
261 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1979  methionine aminopeptidase, type I  57.14 
 
 
276 aa  292  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  57.55 
 
 
260 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  55.92 
 
 
261 aa  291  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  57.55 
 
 
260 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  57.55 
 
 
260 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  57.09 
 
 
259 aa  291  1e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  56.2 
 
 
260 aa  290  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  57.09 
 
 
259 aa  290  1e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  57.55 
 
 
260 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  57.14 
 
 
260 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  55.51 
 
 
260 aa  288  6e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0167  methionine aminopeptidase  54.72 
 
 
260 aa  287  2e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  55.79 
 
 
260 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0856  methionine aminopeptidase  54.15 
 
 
266 aa  287  2e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0337  methionine aminopeptidase, type I  54.12 
 
 
262 aa  285  5.999999999999999e-76  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  54.44 
 
 
255 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  55.1 
 
 
258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  56.79 
 
 
258 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  54.96 
 
 
260 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1064  methionine aminopeptidase  54.55 
 
 
266 aa  280  2e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2421  methionine aminopeptidase, type I  57.2 
 
 
275 aa  278  6e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  54.69 
 
 
267 aa  275  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  53.85 
 
 
268 aa  275  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  54.55 
 
 
267 aa  275  6e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  50.4 
 
 
258 aa  275  8e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  52.99 
 
 
268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  54.18 
 
 
284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  52.65 
 
 
256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  52.99 
 
 
268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  52.99 
 
 
268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  53.04 
 
 
268 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  53.04 
 
 
268 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  53.44 
 
 
268 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  52.24 
 
 
261 aa  270  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  53.47 
 
 
261 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  52.71 
 
 
266 aa  270  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0852  methionine aminopeptidase, type I  52.53 
 
 
263 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  51.7 
 
 
270 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5037  methionine aminopeptidase, type I  50.97 
 
 
268 aa  267  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102807  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0935  methionine aminopeptidase, type I  51.19 
 
 
261 aa  267  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0961494  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3406  methionine aminopeptidase, type I  51.19 
 
 
261 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3273  methionine aminopeptidase, type I  51.19 
 
 
261 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3022  methionine aminopeptidase, type I  51.03 
 
 
255 aa  266  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0974756  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  48.46 
 
 
269 aa  265  5e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  52.7 
 
 
263 aa  265  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  48.46 
 
 
269 aa  265  5e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  51.6 
 
 
274 aa  265  5.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  50.98 
 
 
272 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  50.98 
 
 
272 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  50.98 
 
 
272 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  51.42 
 
 
255 aa  264  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  50.98 
 
 
272 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2587  methionine aminopeptidase, type I  54.22 
 
 
284 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  50.98 
 
 
273 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  53.2 
 
 
274 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  50.98 
 
 
272 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  50.98 
 
 
272 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  48.7 
 
 
275 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>