38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0728 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0728  putative Ig  100 
 
 		 1126 aa  2266    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.218703  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1125  hypothetical protein  53.93 
 
 		 657 aa  83.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.837381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1126  hypothetical protein  53.93 
 
 		 657 aa  83.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  42.27 
 
 		 2961 aa  76.6  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0125  hypothetical protein  40.14 
 
 		 418 aa  73.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  38.3 
 
 		 2831 aa  68.9  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  30.06 
 
 		 1821 aa  66.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0729  cellulosome anchoring protein  30.3 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  27.74 
 
 		 2079 aa  60.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  40.22 
 
 		 731 aa  59.7  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  36.92 
 
 		 1779 aa  58.2  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.92 
 
 		 1884 aa  56.2  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  25.87 
 
 		 3244 aa  54.3  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  26.43 
 
 		 506 aa  54.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1034  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1161 aa  53.5  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  38.89 
 
 		 2636 aa  52  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  30 
 
 		 2656 aa  51.6  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  37.93 
 
 		 1732 aa  51.6  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1975  hypothetical protein  34.12 
 
 		 967 aa  50.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000301767  hitchhiker  0.0000479173 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  37.93 
 
 		 903 aa  49.7  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  40.23 
 
 		 3474 aa  49.7  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  31.71 
 
 		 2392 aa  49.3  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.98 
 
 		 761 aa  49.3  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  33.33 
 
 		 2522 aa  47.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  36.17 
 
 		 2476 aa  47.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  25.89 
 
 		 2820 aa  46.6  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  39.22 
 
 		 834 aa  45.8  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  35.37 
 
 		 3544 aa  45.8  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.28 
 
 		 11716 aa  45.8  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.32 
 
 		 994 aa  46.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  34.83 
 
 		 3089 aa  45.8  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0231  Ig family protein  33.65 
 
 		 556 aa  45.4  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1969  GLUG domain protein  45.1 
 
 		 1143 aa  45.8  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000014348  decreased coverage  0.000000694878 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.04 
 
 		 3699 aa  45.4  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1960  Pyrrolo-quinoline quinone  31.9 
 
 		 484 aa  45.4  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000174419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  35.8 
 
 		 556 aa  45.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1972  hypothetical protein  43.14 
 
 		 1502 aa  45.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.231233  hitchhiker  0.000116216 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  34.04 
 
 		 3699 aa  44.7  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>