More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1947 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1947  glutamine synthetase, type I  100 
 
 		 491 aa  1025    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1891  glutamine synthetase, type I  65.17 
 
 		 472 aa  654    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198707  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1901  glutamine synthetase, type I  61.52 
 
 		 474 aa  630  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.624126  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2983  glutamine synthetase, type I  61.73 
 
 		 474 aa  627  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55604  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0886  glutamine synthetase protein  60.89 
 
 		 491 aa  622  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0716545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4318  glutamine synthetase, type I  61.09 
 
 		 476 aa  623  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2299  L-glutamine synthetase  59.87 
 
 		 475 aa  614  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00444261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1793  glutamine synthetase, type I  60 
 
 		 473 aa  612  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1390  glutamine synthetase, type I  60.48 
 
 		 471 aa  608  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2228  glutamine synthetase, type I  60.39 
 
 		 470 aa  600  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000244418  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3383  glutamine synthetase, type I  58.97 
 
 		 475 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1835  glutamine synthetase, type I  59.96 
 
 		 470 aa  593  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264804  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0576  glutamine synthetase, type I  61.24 
 
 		 470 aa  592  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3077  glutamine synthetase, type I  59.53 
 
 		 470 aa  589  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00183784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1352  L-glutamine synthetase  60.17 
 
 		 470 aa  588  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  hitchhiker  0.000000000000122735 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4408  glutamine synthetase, type I  60.34 
 
 		 474 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1880  glutamine synthetase, type I  60.52 
 
 		 470 aa  587  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000193133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1184  glutamine synthetase, type I  59.74 
 
 		 470 aa  587  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103197 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4385  glutamine synthetase, type I  60.13 
 
 		 474 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  60.43 
 
 		 474 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4252  L-glutamine synthetase  60.13 
 
 		 474 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.631725  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1770  glutamine synthetase, type I  58.64 
 
 		 474 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2629  glutamine synthetase, type I  58.94 
 
 		 474 aa  578  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1262  glutamine synthetase, type I  58.72 
 
 		 474 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0975496  normal  0.0997444 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1501  glutamine synthetase, type I  57.84 
 
 		 469 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000036011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3142  L-glutamine synthetase  57.36 
 
 		 474 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3102  glutamine synthetase, type I  58.39 
 
 		 474 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0143892  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0243  glutamine synthetase, type I  56.45 
 
 		 475 aa  571  1e-161  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.823516  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0988  L-glutamine synthetase  57.32 
 
 		 474 aa  567  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0372208  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1681  glutamine synthetase, type I  58.79 
 
 		 470 aa  567  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000311602  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0932  glutamine synthetase, type I  55.88 
 
 		 474 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.017954 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1915  glutamine synthetase, type I  56.93 
 
 		 472 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.031612  hitchhiker  0.00101897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2203  glutamine synthetase, type I  56.81 
 
 		 473 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000380736 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0923  L-glutamine synthetase  56.26 
 
 		 474 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0837  glutamine synthetase, type I  56.17 
 
 		 473 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0808  glutamine synthetase, type I  56.17 
 
 		 473 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0147  L-glutamine synthetase  55.84 
 
 		 474 aa  553  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3715  glutamine synthetase, type I  56.12 
 
 		 477 aa  554  1e-156  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07500  L-glutamine synthetase  56.81 
 
 		 474 aa  549  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.682112  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4896  glutamine synthetase type I  55.63 
 
 		 479 aa  549  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3291  glutamine synthetase, type I  55.63 
 
 		 474 aa  545  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0215954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7410  glutamine synthetase, type I  55.22 
 
 		 474 aa  545  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1628  glutamine synthetase, type I  54.2 
 
 		 473 aa  546  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2156  L-glutamine synthetase  55.11 
 
 		 473 aa  543  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0673307 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1510  glutamine synthetase, type I  55.93 
 
 		 477 aa  543  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2038  glutamine synthetase, type I  54.78 
 
 		 474 aa  543  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512125  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4575  glutamine synthetase, type I  57.67 
 
 		 470 aa  541  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1855  glutamine synthetase, type I  54.78 
 
 		 474 aa  539  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.636307 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07731  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  55.13 
 
 		 473 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0667695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3834  L-glutamine synthetase  53.73 
 
 		 473 aa  541  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16421  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  54.27 
 
 		 473 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0141  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  54.91 
 
 		 473 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12249  glutamine synthetase glnA1  53.93 
 
 		 478 aa  536  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.465808  normal  0.443746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15370  L-glutamine synthetase  54.78 
 
 		 474 aa  536  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1839  glutamine synthetase, type I  55.81 
 
 		 471 aa  535  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1073  glutamine synthetase, type I  54.99 
 
 		 475 aa  536  1e-151  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16500  L-glutamine synthetase  53.88 
 
 		 476 aa  536  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.399242  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2112  glutamine synthetase, type I  54.78 
 
 		 474 aa  537  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0742231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3585  glutamine synthetase, type I  54.83 
 
 		 478 aa  536  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0280122  normal  0.0233949 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1443  glutamine synthetase, type I  54.12 
 
 		 483 aa  532  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0199962  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3080  glutamine synthetase, type I  54.24 
 
 		 477 aa  532  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0496817  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1265  glutamine synthetase type I  53.63 
 
 		 473 aa  533  1e-150  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0925  glutamine synthetase, type I  54.26 
 
 		 474 aa  534  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0131  glutamine synthetase, type I  55.65 
 
 		 469 aa  533  1e-150  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000917861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0448  glutamine synthetase, type I  54.3 
 
 		 485 aa  533  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00416538 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3373  glutamine synthetase, type I  52.52 
 
 		 477 aa  533  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0880  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  53.83 
 
 		 473 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.980739  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2928  glutamine synthetase, type I  54.62 
 
 		 478 aa  531  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.304351  normal  0.179293 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10271  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  53.19 
 
 		 473 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.18298 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1205  L-glutamine synthetase  53.63 
 
 		 473 aa  527  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.488763  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09401  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  53.62 
 
 		 473 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256855  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09391  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  53.62 
 
 		 473 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3331  L-glutamine synthetase  54.2 
 
 		 478 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3320  L-glutamine synthetase  54.2 
 
 		 478 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3332  glutamine synthetase, type I  53.52 
 
 		 474 aa  526  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0195703  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3382  L-glutamine synthetase  54.2 
 
 		 478 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00327217  normal  0.0657894 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10031  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  53.4 
 
 		 473 aa  522  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.913163  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3568  glutamine synthetase, type I  52.67 
 
 		 474 aa  524  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0683  glutamine synthetase, type I  53.28 
 
 		 473 aa  523  1e-147  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2295  L-glutamine synthetase  52.88 
 
 		 474 aa  523  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3959  glutamine synthetase  53.57 
 
 		 469 aa  520  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1484  glutamine synthetase, type I  53.29 
 
 		 474 aa  518  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.836953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4156  glutamine synthetase  53.57 
 
 		 469 aa  520  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35339  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0828  glutamine synthetase  51.79 
 
 		 478 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03755  glutamine synthetase  53.19 
 
 		 469 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4116  glutamine synthetase, type I  53.19 
 
 		 469 aa  508  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4255  glutamine synthetase  53.19 
 
 		 469 aa  508  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13400  L-glutamine synthetase  52 
 
 		 474 aa  510  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0496712  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4218  glutamine synthetase  52.98 
 
 		 469 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.670348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5316  glutamine synthetase  53.19 
 
 		 469 aa  508  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.961991  normal  0.126376 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0030  glutamine synthetase  53.19 
 
 		 469 aa  508  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4239  glutamine synthetase  52.98 
 
 		 469 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4335  glutamine synthetase  52.98 
 
 		 469 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4392  glutamine synthetase  53.19 
 
 		 469 aa  508  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.519647  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4097  glutamine synthetase  53.19 
 
 		 469 aa  508  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4396  glutamine synthetase  52.98 
 
 		 469 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4189  glutamine synthetase  53.19 
 
 		 469 aa  508  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03704  hypothetical protein  53.19 
 
 		 469 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4289  glutamine synthetase  52.98 
 
 		 469 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4096  glutamine synthetase  53.4 
 
 		 469 aa  509  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>