231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3381 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3381  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  692    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  hitchhiker  0.00468536 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2062  cytochrome c biogenesis protein  63.27 
 
 
325 aa  429  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1277  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  45.63 
 
 
300 aa  287  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  32.38 
 
 
396 aa  90.1  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1106  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.93 
 
 
366 aa  75.9  0.0000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1175  hypothetical protein  24.1 
 
 
471 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4965  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.15 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.508234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.36 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  28.7 
 
 
735 aa  66.2  0.0000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3135  cytochrome c-type biogenesis protein  25.91 
 
 
273 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0405537  normal  0.432106 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2139  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.28 
 
 
695 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0603  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.82 
 
 
672 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.827983  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.56 
 
 
241 aa  63.9  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.47 
 
 
218 aa  62.8  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  28 
 
 
403 aa  62.8  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.85 
 
 
246 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0551  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26 
 
 
223 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000556643  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2222  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.32 
 
 
243 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.45 
 
 
600 aa  60.5  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1457  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.96 
 
 
250 aa  60.1  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00340788  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3668  putative transmembrane cytochrome C biogenesis protein, putative SoxV protein  27 
 
 
244 aa  59.7  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389509  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  27.11 
 
 
403 aa  59.3  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2809  cytochrome c biogenesis protein  22.22 
 
 
244 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.427201 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1840  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.55 
 
 
249 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2966  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.64 
 
 
247 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.017508  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2013  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.29 
 
 
666 aa  57.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.11 
 
 
229 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  23.04 
 
 
603 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4210  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.36 
 
 
245 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2146  cytochrome c biogenesis protein  25.35 
 
 
402 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0617125  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.51 
 
 
240 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1643  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.1 
 
 
249 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0649003  normal  0.267262 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2134  putative cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  26.71 
 
 
248 aa  56.2  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0478142  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  25.48 
 
 
623 aa  56.2  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.71 
 
 
592 aa  56.2  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4148  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.98 
 
 
245 aa  56.2  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  25.48 
 
 
589 aa  55.8  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3785  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.07 
 
 
243 aa  55.8  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2284  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.47 
 
 
223 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000156188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.31 
 
 
235 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.965188  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3474  thiol:disulfide interchange protein  24.55 
 
 
558 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149531  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2596  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.96 
 
 
236 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1270  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.49 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3250  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.49 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0077031  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0808  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.71 
 
 
248 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.29 
 
 
246 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.29 
 
 
246 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0718  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.5 
 
 
248 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.761228  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2546  membrane protein  27.93 
 
 
230 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  23.23 
 
 
605 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.47 
 
 
810 aa  53.9  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2162  cytochrome c-type biogenesis protein  26.75 
 
 
248 aa  53.9  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20604  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7115  Protein-disulfide reductase  26.53 
 
 
658 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0736  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.79 
 
 
222 aa  53.1  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.592681  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0584  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  26.44 
 
 
253 aa  53.1  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3606  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.36 
 
 
240 aa  53.1  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507935  normal  0.590973 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0549  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  26.44 
 
 
248 aa  53.1  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000031904  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3944  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.36 
 
 
240 aa  53.1  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3645  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.61 
 
 
249 aa  53.1  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.42 
 
 
274 aa  52.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.56 
 
 
247 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132104  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15781  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  29.71 
 
 
210 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0899823  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1811  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.82 
 
 
398 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000275773  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3823  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.23 
 
 
246 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.367359  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.29 
 
 
404 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18190  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.89 
 
 
225 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000578008  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.32 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1262  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.23 
 
 
235 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.77 
 
 
244 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18581  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  28.38 
 
 
246 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.236803  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1735  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.26 
 
 
401 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0989  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  27.93 
 
 
246 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.23416  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3204  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.45 
 
 
247 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  25.74 
 
 
731 aa  50.8  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0573  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.77 
 
 
244 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0628  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.96 
 
 
243 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517911  decreased coverage  0.00174403 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1546  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  21.71 
 
 
673 aa  50.8  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.632916  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.22 
 
 
624 aa  51.2  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.88 
 
 
228 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1111  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.67 
 
 
227 aa  50.8  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000199763  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1074  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  22.71 
 
 
607 aa  50.8  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.31 
 
 
586 aa  50.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4973  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  22.22 
 
 
699 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000476148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.04 
 
 
595 aa  50.1  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.04 
 
 
595 aa  50.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  23.04 
 
 
595 aa  50.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  24.66 
 
 
251 aa  50.1  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.493199  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2128  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  22.94 
 
 
235 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  24.51 
 
 
610 aa  50.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2087  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.74 
 
 
242 aa  49.7  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2861  membrane protein  27.8 
 
 
230 aa  49.7  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.563665  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  25.87 
 
 
586 aa  49.3  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2214  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.78 
 
 
244 aa  49.3  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0270  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.58 
 
 
243 aa  49.3  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0502  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.66 
 
 
253 aa  49.3  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3367  cytochrome c-type biogenesis protein (holocytochrome-c synthase)  23.45 
 
 
235 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260903  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  25.87 
 
 
586 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4996  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.09 
 
 
253 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1771  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.36 
 
 
245 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  24.03 
 
 
602 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>